Pyrosequencing-based analysis reveals a novel capsular gene cluster in a KPC-producing Klebsiella pneumoniae clinical isolate identified in Brazil

por Ramos, Pablo Ivan Pereira, Picão, Renata Cristina, Vespero, Eliana Carolina, Pelisson, Marsileni, Zuleta, Luiz Fernando Goda, Almeida, Luiz Gonzaga P, Gerber, Alexandra L, Vasconcelos, Ana Tereza R, Gales, Ana Cristina, Nicolás, Marisa Fabiana
Publicado 2012

Draft Genome Sequence of the d-Xylose-Fermenting Yeast Spathaspora arborariae UFMG-HM19.1A(T)

por Lobo, Francisco P., Gonçalves, Davi L., Alves, Sergio L., Gerber, Alexandra L., de Vasconcelos, Ana Tereza R., Basso, Luiz C., Franco, Glória R., Soares, Marco A., Cadete, Raquel M., Rosa, Carlos A., Stambuk, Boris U.
Publicado 2014

Metagenomic Analysis of the Microbiota from the Crop of an Invasive Snail Reveals a Rich Reservoir of Novel Genes

por Cardoso, Alexander M., Cavalcante, Janaína J. V., Cantão, Maurício E., Thompson, Claudia E., Flatschart, Roberto B., Glogauer, Arnaldo, Scapin, Sandra M. N., Sade, Youssef B., Beltrão, Paulo J. M. S. I., Gerber, Alexandra L., Martins, Orlando B., Garcia, Eloi S., de Souza, Wanderley, Vasconcelos, Ana Tereza R.
Publicado 2012

Genome-wide diversity and differentiation in New World populations of the human malaria parasite Plasmodium vivax

por de Oliveira, Thais C., Rodrigues, Priscila T., Menezes, Maria José, Gonçalves-Lopes, Raquel M., Bastos, Melissa S., Lima, Nathália F., Barbosa, Susana, Gerber, Alexandra L., Loss de Morais, Guilherme, Berná, Luisa, Phelan, Jody, Robello, Carlos, de Vasconcelos, Ana Tereza R., Alves, João Marcelo P., Ferreira, Marcelo U.
Publicado 2017

Clinical markers of post-Chikungunya chronic inflammatory joint disease: A Brazilian cohort

por Lázari, Carolina dos Santos, Ramundo, Mariana Severo, ten-Caten, Felipe, Bressan, Clarisse S., de Filippis, Ana Maria Bispo, Manuli, Erika Regina, de Moraes, Isabella, Pereira, Geovana Maria, Côrtes, Marina Farrel, Candido, Darlan da Silva, Gerber, Alexandra L., Guimarães, Ana Paula, Faria, Nuno Rodrigues, Nakaya, Helder I., Vasconcelos, Ana Tereza R., Brasil, Patrícia, Paranhos-Baccalà, Gláucia, Sabino, Ester Cerdeira
Publicado 2023

Isolation of Infective Zika Virus from Urine and Saliva of Patients in Brazil

por Bonaldo, Myrna C., Ribeiro, Ieda P., Lima, Noemia S., dos Santos, Alexandre A. C., Menezes, Lidiane S. R., da Cruz, Stephanie O. D., de Mello, Iasmim S., Furtado, Nathália D., de Moura, Elaine E., Damasceno, Luana, da Silva, Kely A. B., de Castro, Marcia G., Gerber, Alexandra L., de Almeida, Luiz G. P., Lourenço-de-Oliveira, Ricardo, Vasconcelos, Ana Tereza R., Brasil, Patrícia
Publicado 2016

Zika virus targets the human thymic epithelium

por Messias, Carolina V., Loss-Morais, Guilherme, Carvalho, Joseane Biso de, González, Mariela N., Cunha, Daniela P., Vasconcelos, Zilton, Arge, Luis W. P., Farias-de-Oliveira, Désio A., Gerber, Alexandra L., Portari, Elyzabeth A., Ferreira, Nilma, Raphael, Lidiane M. S., Bonaldo, Myrna C., Riederer, Ingo, Lopes Moreira, Maria E., Cotta-de-Almeida, Vinicius, Vasconcelos, Ana T. R., Mendes-da-Cruz, Daniella A., Savino, Wilson
Publicado 2020

Pervasive transmission of E484K and emergence of VUI-NP13L with evidence of SARS-CoV-2 co-infection events by two different lineages in Rio Grande do Sul, Brazil

por Francisco Jr, Ronaldo da Silva, Benites, L. Felipe, Lamarca, Alessandra P., de Almeida, Luiz G.P., Hansen, Alana Witt, Gularte, Juliana Schons, Demoliner, Meriane, Gerber, Alexandra L., de C Guimarães, Ana Paula, Antunes, Ana Karolina Eisen, Heldt, Fagner Henrique, Mallmann, Larissa, Hermann, Bruna, Ziulkoski, Ana Luiza, Goes, Vyctoria, Schallenberger, Karoline, Fillipi, Micheli, Pereira, Francini, Weber, Matheus Nunes, de Almeida, Paula Rodrigues, Fleck, Juliane Deise, Vasconcelos, Ana Tereza R., Spilki, Fernando Rosado
Publicado 2021

Genomic Characterization of a Novel SARS-CoV-2 Lineage from Rio de Janeiro, Brazil

por Voloch, Carolina M., da Silva Francisco, Ronaldo, de Almeida, Luiz G. P., Cardoso, Cynthia C., Brustolini, Otavio J., Gerber, Alexandra L., Guimarães, Ana Paula de C., Mariani, Diana, da Costa, Raissa Mirella, Ferreira, Orlando C., Cavalcanti, Adriana Cony, Frauches, Thiago Silva, de Mello, Claudia Maria Braga, Leitão, Isabela de Carvalho, Galliez, Rafael Mello, Faffe, Débora Souza, Castiñeiras, Terezinha M. P. P., Tanuri, Amilcar, de Vasconcelos, Ana Tereza R.
Publicado 2021

Intra-host evolution during SARS-CoV-2 prolonged infection

por Voloch, Carolina M, da Silva Francisco Jr, Ronaldo, de Almeida, Luiz G P, Brustolini, Otavio J, Cardoso, Cynthia C, Gerber, Alexandra L, Guimarães, Ana Paula de C, Leitão, Isabela de Carvalho, Mariani, Diana, Ota, Victor Akira, Lima, Cristiano X, Teixeira, Mauro M, Dias, Ana Carolina F, Galliez, Rafael Mello, Faffe, Débora Souza, Pôrto, Luís Cristóvão, Aguiar, Renato S, Castiñeira, Terezinha M P P, Ferreira, Orlando C, Tanuri, Amilcar, R de Vasconcelos, Ana Tereza
Publicado 2021

Genomic surveillance of SARS-CoV-2 tracks early interstate transmission of P.1 lineage and diversification within P.2 clade in Brazil

por Lamarca, Alessandra P., de Almeida, Luiz G. P., Francisco, Ronaldo da Silva, Lima, Lucymara Fassarella Agnez, Scortecci, Kátia Castanho, Perez, Vinícius Pietta, Brustolini, Otavio J., Sousa, Eduardo Sérgio Soares, Secco, Danielle Angst, Santos, Angela Maria Guimarães, Albuquerque, George Rego, Mariano, Ana Paula Melo, Maciel, Bianca Mendes, Gerber, Alexandra L., Guimarães, Ana Paula de C., Nascimento, Paulo Ricardo, Neto, Francisco Paulo Freire, Gadelha, Sandra Rocha, Porto, Luís Cristóvão, Campana, Eloiza Helena, Jeronimo, Selma Maria Bezerra, Vasconcelos, Ana Tereza R.
Publicado 2021

Genomic Surveillance Tracks the First Community Outbreak of the SARS-CoV-2 Delta (B.1.617.2) Variant in Brazil

por Lamarca, Alessandra P., de Almeida, Luiz G. P., da Silva Francisco, Ronaldo, Cavalcante, Liliane, Machado, Douglas Terra, Brustolini, Otávio, Gerber, Alexandra L., Guimarães, Ana Paula de C., Policarpo, Cintia, de Oliveira, Gleidson da Silva, Boullosa, Lidia Theodoro, de Souza, Isabelle Vasconcellos, de Carvalho, Erika Martins, Ribeiro, Mario Sergio, Carvalho, Silvia, da Silva, Flávio Dias, Garcia, Marcio Henrique de Oliveira, de Souza, Leandro Magalhães, Silva, Cristiane Gomes Da, Ribeiro, Caio Luiz Pereira, Cavalcanti, Andréa Cony, de Mello, Claudia Maria Braga, Tanuri, Amilcar, Vasconcelos, Ana Tereza R.
Publicado 2022

Emergence of Within-Host SARS-CoV-2 Recombinant Genome After Coinfection by Gamma and Delta Variants: A Case Report

por Francisco Junior, Ronaldo da Silva, de Almeida, Luiz G. P., Lamarca, Alessandra P., Cavalcante, Liliane, Martins, Yasmmin, Gerber, Alexandra L., Guimarães, Ana Paula de C., Salviano, Ricardo Barbosa, dos Santos, Fernanda Leitão, de Oliveira, Thiago Henrique, de Souza, Isabelle Vasconcellos, de Carvalho, Erika Martins, Ribeiro, Mario Sergio, Carvalho, Silvia, da Silva, Flávio Dias, Garcia, Marcio Henrique de Oliveira, de Souza, Leandro Magalhães, da Silva, Cristiane Gomes, Ribeiro, Caio Luiz Pereira, Cavalcanti, Andréa Cony, de Mello, Claudia Maria Braga, Tanuri, Amilcar, Vasconcelos, Ana Tereza R.
Publicado 2022

Phylodynamic analysis of SARS-CoV-2 spread in Rio de Janeiro, Brazil, highlights how metropolitan areas act as dispersal hubs for new variants

por Lamarca, Alessandra Pavan, de Almeida, Luiz G. P., Francisco, Ronaldo da Silva, Cavalcante, Liliane, Brustolini, Otávio, Gerber, Alexandra L., Guimarães, Ana Paula de C., de Oliveira, Thiago Henrique, dos Santos Nascimento, Érica Ramos, Policarpo, Cintia, de Souza, Isabelle Vasconcellos, de Carvalho, Erika Martins, Ribeiro, Mario Sergio, Carvalho, Silvia, Dias da Silva, Flávio, de Oliveira Garcia, Marcio Henrique, de Souza, Leandro Magalhães, Da Silva, Cristiane Gomes, Ribeiro, Caio Luiz Pereira, Cavalcanti, Andréa Cony, de Mello, Claudia Maria Braga, Tanuri, Amilcar, de Vasconcelos, Ana Tereza R.
Publicado 2022

Turnover of SARS-CoV-2 Lineages Shaped the Pandemic and Enabled the Emergence of New Variants in the State of Rio de Janeiro, Brazil

por da Silva Francisco Junior, Ronaldo, Lamarca, Alessandra P, de Almeida, Luiz G P, Cavalcante, Liliane, Machado, Douglas Terra, Martins, Yasmmin, Brustolini, Otávio, Gerber, Alexandra L, de C Guimarães, Ana Paula, Gonçalves, Reinaldo Bellini, Alves, Cassia, Mariani, Diana, Cruz, Thais Felix, de Souza, Isabelle Vasconcellos, de Carvalho, Erika Martins, Ribeiro, Mario Sergio, Carvalho, Silvia, da Silva, Flávio Dias, de Oliveira Garcia, Márcio Henrique, de Souza, Leandro Magalhães, da Silva, Cristiane Gomes, Ribeiro, Caio Luiz Pereira, Cavalcanti, Andréa Cony, de Mello, Claudia Maria Braga, Struchiner, Cláudio J., Tanuri, Amilcar, Vasconcelos, Ana Tereza R
Publicado 2021

Distinct patterns of somatic alterations in a lymphoblastoid and a tumor genome derived from the same individual

por Galante, Pedro A. F., Parmigiani, Raphael B., Zhao, Qi, Caballero, Otávia L., de Souza, Jorge E., Navarro, Fábio C. P., Gerber, Alexandra L., Nicolás, Marisa F., Salim, Anna Christina M., Silva, Ana Paula M., Edsall, Lee, Devalle, Sylvie, Almeida, Luiz G., Ye, Zhen, Kuan, Samantha, Pinheiro, Daniel G., Tojal, Israel, Pedigoni, Renato G., de Sousa, Rodrigo G. M. A., Oliveira, Thiago Y. K., de Paula, Marcelo G., Ohno-Machado, Lucila, Kirkness, Ewen F., Levy, Samuel, da Silva, Wilson A., Vasconcelos, Ana Tereza R., Ren, Bing, Zago, Marco Antonio, Strausberg, Robert L., Simpson, Andrew J. G., de Souza, Sandro J., Camargo, Anamaria A.
Publicado 2011

Comparative genomics of the major fungal agents of human and animal Sporotrichosis: Sporothrix schenckii and Sporothrix brasiliensis

por Teixeira, Marcus M, de Almeida, Luiz GP, Kubitschek-Barreira, Paula, Alves, Fernanda L, Kioshima, Érika S, Abadio, Ana KR, Fernandes, Larissa, Derengowski, Lorena S, Ferreira, Karen S, Souza, Rangel C, Ruiz, Jeronimo C, de Andrade, Nathalia C, Paes, Hugo C, Nicola, André M, Albuquerque, Patrícia, Gerber, Alexandra L, Martins, Vicente P, Peconick, Luisa DF, Neto, Alan Viggiano, Chaucanez, Claudia B, Silva, Patrícia A, Cunha, Oberdan L, de Oliveira, Fabiana FM, dos Santos, Tayná C, Barros, Amanda LN, Soares, Marco A, de Oliveira, Luciana M, Marini, Marjorie M, Villalobos-Duno, Héctor, Cunha, Marcel ML, de Hoog, Sybren, da Silveira, José F, Henrissat, Bernard, Niño-Vega, Gustavo A, Cisalpino, Patrícia S, Mora-Montes, Héctor M, Almeida, Sandro R, Stajich, Jason E, Lopes-Bezerra, Leila M, Vasconcelos, Ana TR, Felipe, Maria SS
Publicado 2014

The Omicron Lineages BA.1 and BA.2 (Betacoronavirus SARS-CoV-2) Have Repeatedly Entered Brazil through a Single Dispersal Hub

por Lamarca, Alessandra P., de Souza, Ueric José Borges, Moreira, Filipe Romero Rebello, de Almeida, Luiz G. P., de Menezes, Mariane Talon, de Souza, Adrieli Barboza, Ferreira, Alessandro Clayton de Souza, Gerber, Alexandra L., de Lima, Aline B., Guimarães, Ana Paula de C., Cavalcanti, Andréa Cony, Silva, Aryel B. Paz e, Lima, Bruna Israel, Lobato, Cirley, Silva, Cristiane Gomes Da, Mendonça, Cristiane P. T. B., Queiroz, Daniel Costa, Zauli, Danielle Alves Gomes, Menezes, Diego, Possebon, Fábio Sossai, Cardoso, Franciano Dias Pereira, Malta, Frederico Scott Varella, Braga-Paz, Isabela, Silva, Joice do Prado, Ferreira, Jorge Gomes Goulart, Galvão, Jucimária Dantas, de Souza, Leandro Magalhães, Ferreira, Leonardo, Possuelo, Lia Gonçalves, Cavalcante, Liliane Tavares de Faria, Alvim, Luige B., de Souza, Luiz Fellype Alves, Santos, Luiza C. G. de Araújo E, Dias, Rillery Calixto, Souza, Rutilene Barbosa, Castro, Thaís Regina y, Valim, Andréia Rosane de Moura, Campos, Fabrício Souza, Araujo, João Pessoa, Trindade, Priscila de Arruda, Aguiar, Renato S., Michael Delai, Robson, de Vasconcelos, Ana Tereza R
Publicado 2023

Evolution and epidemic spread of SARS-CoV-2 in Brazil

por Candido, Darlan S., Claro, Ingra M., de Jesus, Jaqueline G., Souza, William M., Moreira, Filipe R. R., Dellicour, Simon, Mellan, Thomas A., du Plessis, Louis, Pereira, Rafael H. M., Sales, Flavia C. S., Manuli, Erika R., Thézé, Julien, Almeida, Luiz, Menezes, Mariane T., Voloch, Carolina M., Fumagalli, Marcilio J., Coletti, Thaís M., da Silva, Camila A. M., Ramundo, Mariana S., Amorim, Mariene R., Hoeltgebaum, Henrique H., Mishra, Swapnil, Gill, Mandev S., Carvalho, Luiz M., Buss, Lewis F., Prete, Carlos A., Ashworth, Jordan, Nakaya, Helder I., Peixoto, Pedro S., Brady, Oliver J., Nicholls, Samuel M., Tanuri, Amilcar, Rossi, Átila D., Braga, Carlos K.V., Gerber, Alexandra L., de C. Guimarães, Ana Paula, Gaburo, Nelson, Alencar, Cecila Salete, Ferreira, Alessandro C.S., Lima, Cristiano X., Levi, José Eduardo, Granato, Celso, Ferreira, Giulia M., Francisco, Ronaldo S., Granja, Fabiana, Garcia, Marcia T., Moretti, Maria Luiza, Perroud, Mauricio W., Castiñeiras, Terezinha M. P. P., Lazari, Carolina S., Hill, Sarah C., de Souza Santos, Andreza Aruska, Simeoni, Camila L., Forato, Julia, Sposito, Andrei C., Schreiber, Angelica Z., Santos, Magnun N. N., de Sá, Camila Zolini, Souza, Renan P., Resende-Moreira, Luciana C., Teixeira, Mauro M., Hubner, Josy, Leme, Patricia A. F., Moreira, Rennan G, Nogueira, Maurício L., Ferguson, Neil M, Costa, Silvia F., Proenca-Modena, José Luiz, Vasconcelos, Ana Tereza R., Bhatt, Samir, Lemey, Philippe, Wu, Chieh-Hsi, Rambaut, Andrew, Loman, Nick J., Aguiar, Renato S., Pybus, Oliver G., Sabino, Ester C., Faria, Nuno Rodrigues
Publicado 2020