Quantitative analysis of 3D alignment quality: its impact on soft-validation, particle pruning and homogeneity analysis

por Vargas, J., Melero, R., Gómez-Blanco, J., Carazo, J. M., Sorzano, C. O. S.
Publicado 2017

Scipion Flexibility Hub: an integrative framework for advanced analysis of conformational heterogeneity in cryoEM

por Herreros, D., Krieger, J. M., Fonseca, Y., Conesa, P., Harastani, M., Vuillemot, R., Hamitouche, I., Serrano Gutiérrez, R., Gragera, M., Melero, R., Jonic, S., Carazo, J. M., Sorzano, C. O. S.
Publicado 2023

Measurement of local resolution in electron tomography

por Vilas, J.L., Oton, J., Messaoudi, C., Melero, R., Conesa, P., Ramirez-Aportela, E., Mota, J., Martinez, M., Jimenez, A., Marabini, R., Carazo, J.M., Vargas, J., Sorzano, C.O.S.
Publicado 2019

Cryo-EM and the elucidation of new macromolecular structures: Random Conical Tilt revisited

por Sorzano, C. O. S., Alcorlo, M., de la Rosa-Trevín, J. M., Melero, R., Foche, I., Zaldívar-Peraza, A., del Cano, L., Vargas, J., Abrishami, V., Otón, J., Marabini, R., Carazo, J. M.
Publicado 2015

A Survey of the Use of Iterative Reconstruction Algorithms in Electron Microscopy

por Sorzano, C. O. S., Vargas, J., Otón, J., de la Rosa-Trevín, J. M., Vilas, J. L., Kazemi, M., Melero, R., del Caño, L., Cuenca, J., Conesa, P., Gómez-Blanco, J., Marabini, R., Carazo, J. M.
Publicado 2017

Flexible workflows for on-the-fly electron-microscopy single-particle image processing using Scipion

por Maluenda, D., Majtner, T., Horvath, P., Vilas, J. L., Jiménez-Moreno, A., Mota, J., Ramírez-Aportela, E., Sánchez-García, R., Conesa, P., del Caño, L., Rancel, Y., Fonseca, Y., Martínez, M., Sharov, G., García, C.A., Strelak, D., Melero, R., Marabini, R., Carazo, J. M., Sorzano, C. O. S.
Publicado 2019

Using Scipion for stream image processing at Cryo-EM facilities

por Gómez-Blanco, J., de la Rosa-Trevín, J.M., Marabini, R., del Cano, L., Jiménez, A., Martínez, M., Melero, R., Majtner, T., Maluenda, D., Mota, J., Rancel, Y., Ramírez-Aportela, E, Vilas, J.L., Carroni, M., Fleischmann, S., Lindahl, E., Ashton, A.W., Basham, M., Clare, D.K., Savage, K., Siebert, C.A., Sharov, G.G., Sorzano, C.O.S., Conesa, P., Carazo, J.M.
Publicado 2018

On bias, variance, overfitting, gold standard and consensus in single-particle analysis by cryo-electron microscopy

por Sorzano, C. O. S., Jiménez-Moreno, A., Maluenda, D., Martínez, M., Ramírez-Aportela, E., Krieger, J., Melero, R., Cuervo, A., Conesa, J., Filipovic, J., Conesa, P., del Caño, L., Fonseca, Y. C., Jiménez-de la Morena, J., Losana, P., Sánchez-García, R., Strelak, D., Fernández-Giménez, E., de Isidro-Gómez, F. P., Herreros, D., Vilas, J. L., Marabini, R., Carazo, J. M.
Publicado 2022

ScipionTomo: Towards cryo-electron tomography software integration, reproducibility, and validation

por de la Morena, J. Jimenez, Conesa, P., Fonseca, Y.C., de Isidro-Gómez, F.P., Herreros, D., Fernández-Giménez, E., Strelaka, D., Moebel, E., Buchholz, T.O., Jug, F., Martinez-Sanchez, A., Harastani, M., Jonic, S., Conesa, J.J., Cuervo, A., Losana, P., Sánchez, I., Iceta, M., del Cano, L., Gragera, M., Melero, R., Sharov, G., Castaño-Díez, D., Koster, A., Piccirillo, J.G., Vilas, J.L., Otón, J., Marabini, R., Sorzano, C.O.S., Carazo, J.M.
Publicado 2022