Large-Scale Protein Interactions Prediction by Multiple Evidence Analysis Associated With an In-Silico Curation Strategy

por Martins, Yasmmin Côrtes, Ziviani, Artur, Nicolás, Marisa Fabiana, de Vasconcelos, Ana Tereza Ribeiro
Publicado 2021

Analysis of a novel class A β-lactamase OKP-B-6 of Klebsiella quasipneumoniae: structural characterisation and interaction with commercially available drugs

por Bellini, Reinaldo, Guedes, Isabella Alvim, Ciapina, Luciane Prioli, de Vasconcelos, Ana Tereza Ribeiro, Dardenne, Laurent Emmanuel, Nicolás, Marisa Fabiana
Publicado 2022

PPIntegrator: semantic integrative system for protein–protein interaction and application for host–pathogen datasets

por Martins, Yasmmin Côrtes, Ziviani, Artur, Cerqueira e Costa, Maiana de Oliveira, Cavalcanti, Maria Cláudia Reis, Nicolás, Marisa Fabiana, de Vasconcelos, Ana Tereza Ribeiro
Publicado 2023

Comparative metagenome of a stream impacted by the urbanization phenomenon

por Medeiros, Julliane Dutra, Cantão, Maurício Egídio, Cesar, Dionéia Evangelista, Nicolás, Marisa Fabiana, Diniz, Cláudio Galuppo, Silva, Vânia Lúcia, Vasconcelos, Ana Tereza Ribeiro de, Coelho, Cíntia Marques
Publicado 2016

The gene regulatory network of Staphylococcus aureus ST239-SCCmecIII strain Bmb9393 and assessment of genes associated with the biofilm in diverse backgrounds

por Costa, Maiana de Oliveira Cerqueira e, do Nascimento, Ana Paula Barbosa, Martins, Yasmmin Cortes, dos Santos, Marcelo Trindade, Figueiredo, Agnes Marie de Sá, Perez-Rueda, Ernesto, Nicolás, Marisa Fabiana
Publicado 2023

Pyrosequencing-based analysis reveals a novel capsular gene cluster in a KPC-producing Klebsiella pneumoniae clinical isolate identified in Brazil

por Ramos, Pablo Ivan Pereira, Picão, Renata Cristina, Vespero, Eliana Carolina, Pelisson, Marsileni, Zuleta, Luiz Fernando Goda, Almeida, Luiz Gonzaga P, Gerber, Alexandra L, Vasconcelos, Ana Tereza R, Gales, Ana Cristina, Nicolás, Marisa Fabiana
Publicado 2012

Complete Genome Sequence of a Variant of the Methicillin-Resistant Staphylococcus aureus ST239 Lineage, Strain BMB9393, Displaying Superior Ability To Accumulate ica-Independent Bi...

por Costa, Maiana Oliveira Cerqueira, Beltrame, Cristiana Ossaille, Ferreira, Fabienne Antunes, Botelho, Ana Maria Nunes, Lima, Nicholas Costa Barroso, Souza, Rangel Celso, de Almeida, Luiz Gonzaga Paula, Vasconcelos, Ana Tereza Ribeiro, Nicolás, Marisa Fabiana, Figueiredo, Agnes Marie Sá
Publicado 2013

A Systematic Strategy to Find Potential Therapeutic Targets for Pseudomonas aeruginosa Using Integrated Computational Models

por Medeiros Filho, Fernando, do Nascimento, Ana Paula Barbosa, Costa, Maiana de Oliveira Cerqueira e, Merigueti, Thiago Castanheira, de Menezes, Marcio Argollo, Nicolás, Marisa Fabiana, dos Santos, Marcelo Trindade, Carvalho-Assef, Ana Paula D’Alincourt, da Silva, Fabrício Alves Barbosa
Publicado 2021

The polymyxin B-induced transcriptomic response of a clinical, multidrug-resistant Klebsiella pneumoniae involves multiple regulatory elements and intracellular targets

por Ramos, Pablo Ivan Pereira, Custódio, Márlon Grégori Flores, Quispe Saji, Guadalupe del Rosario, Cardoso, Thiago, da Silva, Gisele Lucchetti, Braun, Graziela, Martins, Willames M. B. S., Girardello, Raquel, de Vasconcelos, Ana Tereza Ribeiro, Fernández, Elmer, Gales, Ana Cristina, Nicolás, Marisa Fabiana
Publicado 2016

Genomic basis of broad host range and environmental adaptability of Rhizobium tropici CIAT 899 and Rhizobium sp. PRF 81 which are used in inoculants for common bean (Phaseolus vulg...

por Ormeño-Orrillo, Ernesto, Menna, Pâmela, Almeida, Luiz Gonzaga P, Ollero, Francisco Javier, Nicolás, Marisa Fabiana, Pains Rodrigues, Elisete, Shigueyoshi Nakatani, Andre, Silva Batista, Jesiane Stefânia, Oliveira Chueire, Ligia Maria, Souza, Rangel Celso, Ribeiro Vasconcelos, Ana Tereza, Megías, Manuel, Hungria, Mariangela, Martínez-Romero, Esperanza
Publicado 2012

Comparative analysis of the complete genome of KPC-2-producing Klebsiella pneumoniae Kp13 reveals remarkable genome plasticity and a wide repertoire of virulence and resistance mec...

por Ramos, Pablo Ivan Pereira, Picão, Renata Christina, Almeida, Luiz Gonzaga Paula de, Lima, Nicholas Costa B, Girardello, Raquel, Vivan, Ana Carolina P, Xavier, Danilo E, Barcellos, Fernando G, Pelisson, Marsileni, Vespero, Eliana C, Médigue, Claudine, Vasconcelos, Ana Tereza Ribeiro de, Gales, Ana Cristina, Nicolás, Marisa Fabiana
Publicado 2014

De novo transcriptome analysis of Hevea brasiliensis tissues by RNA-seq and screening for molecular markers

por Salgado, Leonardo Rippel, Koop, Daniela Martins, Pinheiro, Daniel Guariz, Rivallan, Ronan, Le Guen, Vincent, Nicolás, Marisa Fabiana, de Almeida, Luiz Gonzaga Paula, Rocha, Viviani Ribeiro, Magalhães, Milena, Gerber, Alexandra Lehmkuhl, Figueira, Antonio, Cascardo, Júlio Cézar de Mattos, de Vasconcelos, AnaTereza Ribeiro, Silva, Wilson Araújo, Coutinho, Luiz Lehmann, Garcia, Dominique
Publicado 2014

Local Diversification of Methicillin- Resistant Staphylococcus aureus ST239 in South America After Its Rapid Worldwide Dissemination

por Botelho, Ana Maria Nunes, Cerqueira e Costa, Maiana Oliveira, Moustafa, Ahmed M., Beltrame, Cristiana Ossaille, Ferreira, Fabienne Antunes, Côrtes, Marina Farrel, Costa, Bruno Souza Scramignon, Silva, Deborah Nascimento Santos, Bandeira, Paula Terra, Lima, Nicholas Costa Barroso, Souza, Rangel Celso, de Almeida, Luiz Gonzaga Paula, Vasconcelos, Ana Tereza Ribeiro, Narechania, Apurva, Ryan, Chanelle, O’Brien, Kelsey, Kolokotronis, Sergios-Orestis, Planet, Paul J., Nicolás, Marisa Fabiana, Figueiredo, Agnes Marie Sá
Publicado 2019

The Genome of Anopheles darlingi, the main neotropical malaria vector

por Marinotti, Osvaldo, Cerqueira, Gustavo C., de Almeida, Luiz Gonzaga Paula, Ferro, Maria Inês Tiraboschi, Loreto, Elgion Lucio da Silva, Zaha, Arnaldo, Teixeira, Santuza M. R., Wespiser, Adam R., Almeida e Silva, Alexandre, Schlindwein, Aline Daiane, Pacheco, Ana Carolina Landim, da Silva, Artur Luiz da Costa, Graveley, Brenton R., Walenz, Brian P., Lima, Bruna de Araujo, Ribeiro, Carlos Alexandre Gomes, Nunes-Silva, Carlos Gustavo, de Carvalho, Carlos Roberto, Soares, Célia Maria de Almeida, de Menezes, Claudia Beatriz Afonso, Matiolli, Cleverson, Caffrey, Daniel, Araújo, Demetrius Antonio M., de Oliveira, Diana Magalhães, Golenbock, Douglas, Grisard, Edmundo Carlos, Fantinatti-Garboggini, Fabiana, de Carvalho, Fabíola Marques, Barcellos, Fernando Gomes, Prosdocimi, Francisco, May, Gemma, de Azevedo Junior, Gilson Martins, Guimarães, Giselle Moura, Goldman, Gustavo Henrique, Padilha, Itácio Q. M., Batista, Jacqueline da Silva, Ferro, Jesus Aparecido, Ribeiro, José M. C., Fietto, Juliana Lopes Rangel, Dabbas, Karina Maia, Cerdeira, Louise, Agnez-Lima, Lucymara Fassarella, Brocchi, Marcelo, de Carvalho, Marcos Oliveira, Teixeira, Marcus de Melo, Diniz Maia, Maria de Mascena, Goldman, Maria Helena S., Cruz Schneider, Maria Paula, Felipe, Maria Sueli Soares, Hungria, Mariangela, Nicolás, Marisa Fabiana, Pereira, Maristela, Montes, Martín Alejandro, Cantão, Maurício E., Vincentz, Michel, Rafael, Miriam Silva, Silverman, Neal, Stoco, Patrícia Hermes, Souza, Rangel Celso, Vicentini, Renato, Gazzinelli, Ricardo Tostes, Neves, Rogério de Oliveira, Silva, Rosane, Astolfi-Filho, Spartaco, Maciel, Talles Eduardo Ferreira, Ürményi, Turán P., Tadei, Wanderli Pedro, Camargo, Erney Plessmann, de Vasconcelos, Ana Tereza Ribeiro
Publicado 2013

Genome of Herbaspirillum seropedicae Strain SmR1, a Specialized Diazotrophic Endophyte of Tropical Grasses

por Pedrosa, Fábio O., Monteiro, Rose Adele, Wassem, Roseli, Cruz, Leonardo M., Ayub, Ricardo A., Colauto, Nelson B., Fernandez, Maria Aparecida, Fungaro, Maria Helena P., Grisard, Edmundo C., Hungria, Mariangela, Madeira, Humberto M. F., Nodari, Rubens O., Osaku, Clarice A., Petzl-Erler, Maria Luiza, Terenzi, Hernán, Vieira, Luiz G. E., Steffens, Maria Berenice R., Weiss, Vinicius A., Pereira, Luiz F. P., Almeida, Marina I. M., Alves, Lysangela R., Marin, Anelis, Araujo, Luiza Maria, Balsanelli, Eduardo, Baura, Valter A., Chubatsu, Leda S., Faoro, Helisson, Favetti, Augusto, Friedermann, Geraldo, Glienke, Chirlei, Karp, Susan, Kava-Cordeiro, Vanessa, Raittz, Roberto T., Ramos, Humberto J. O., Ribeiro, Enilze Maria S. F., Rigo, Liu Un, Rocha, Saul N., Schwab, Stefan, Silva, Anilda G., Souza, Eliel M., Tadra-Sfeir, Michelle Z., Torres, Rodrigo A., Dabul, Audrei N. G., Soares, Maria Albertina M., Gasques, Luciano S., Gimenes, Ciela C. T., Valle, Juliana S., Ciferri, Ricardo R., Correa, Luiz C., Murace, Norma K., Pamphile, João A., Patussi, Eliana Valéria, Prioli, Alberto J., Prioli, Sonia Maria A., Rocha, Carmem Lúcia M. S. C., Arantes, Olívia Márcia N., Furlaneto, Márcia Cristina, Godoy, Leandro P., Oliveira, Carlos E. C., Satori, Daniele, Vilas-Boas, Laurival A., Watanabe, Maria Angélica E., Dambros, Bibiana Paula, Guerra, Miguel P., Mathioni, Sandra Marisa, Santos, Karine Louise, Steindel, Mario, Vernal, Javier, Barcellos, Fernando G., Campo, Rubens J., Chueire, Ligia Maria O., Nicolás, Marisa Fabiana, Pereira-Ferrari, Lilian, da Conceição Silva, José L., Gioppo, Nereida M. R., Margarido, Vladimir P., Menck-Soares, Maria Amélia, Pinto, Fabiana Gisele S., Simão, Rita de Cássia G., Takahashi, Elizabete K., Yates, Marshall G., Souza, Emanuel M.
Publicado 2011