Genome-resolved metagenome and metatranscriptome analyses of thermophilic composting reveal key bacterial players and their metabolic interactions

por Braga, Lucas Palma Perez, Pereira, Roberta Verciano, Martins, Layla Farage, Moura, Livia Maria Silva, Sanchez, Fabio Beltrame, Patané, José Salvatore Leister, da Silva, Aline Maria, Setubal, João Carlos
Publicado 2021

The rate and role of pseudogenes of the Mycobacterium tuberculosis complex

por Soler-Camargo, Naila Cristina, Silva-Pereira, Taiana Tainá, Zimpel, Cristina Kraemer, Camacho, Maurício F., Zelanis, André, Aono, Alexandre H., Patané, José Salvatore, dos Santos, Andrea Pires, Guimarães, Ana Marcia Sá
Publicado 2022

Identification of Novel Interspersed DNA Repetitive Elements in the Trypanosoma cruzi Genome Associated with the 3′UTRs of Surface Multigenic Families

por Calderano, Simone Guedes, Nishiyama Junior, Milton Yutaka, Marini, Marjorie, Nunes, Nathan de Oliveira, Reis, Marcelo da Silva, Patané, José Salvatore Leister, da Silveira, José Franco, da Cunha, Julia Pinheiro Chagas, Elias, Maria Carolina
Publicado 2020

Global Distribution and Evolution of Mycobacterium bovis Lineages

por Zimpel, Cristina Kraemer, Patané, José Salvatore L., Guedes, Aureliano Coelho Proença, de Souza, Robson F., Silva-Pereira, Taiana T., Camargo, Naila C. Soler, de Souza Filho, Antônio F., Ikuta, Cássia Y., Neto, José Soares Ferreira, Setubal, João Carlos, Heinemann, Marcos Bryan, Guimaraes, Ana Marcia Sa
Publicado 2020

In Silico Prediction and Design of Uropathogenic Escherichia coli Alpha-Hemolysin Generate a Soluble and Hemolytic Recombinant Toxin

por Caetano, Bruna De Lucca, Domingos, Marta de Oliveira, da Silva, Miriam Aparecida, da Silva, Jessika Cristina Alves, Polatto, Juliana Moutinho, Montoni, Fabio, Iwai, Leo Kei, Pimenta, Daniel Carvalho, Vigerelli, Hugo, Vieira, Paulo Cesar Gomes, Ruiz, Rita de Cassia, Patané, José Salvatore, Piazza, Roxane Maria Fontes
Publicado 2022

Complete genome sequence and analysis of Alcaligenes faecalis strain Mc250, a new potential plant bioinoculant

por Felestrino, Érica Barbosa, Sanchez, Angélica Bianchini, Caneschi, Washington Luiz, Lemes, Camila Gracyelle de Carvalho, Assis, Renata de Almeida Barbosa, Cordeiro, Isabella Ferreira, Fonseca, Natasha Peixoto, Villa, Morghana Marina, Vieira, Izadora Tabuso, Kamino, Luciana Hiromi Yoshino, do Carmo, Flávio Fonseca, da Silva, Aline Maria, Thomas, Andrew Maltez, Patané, José Salvatore Leister, Ferreira, Fernanda Carla, de Freitas, Leandro Grassi, Varani, Alessandro de Mello, Ferro, Jesus Aparecido, Silva, Robson Soares, Almeida, Nalvo Franco, Garcia, Camila Carrião Machado, Setubal, João Carlos, Moreira, Leandro Marcio
Publicado 2020

A novel Sporothrix brasiliensis genomic variant in Midwestern Brazil: evidence for an older and wider sporotrichosis epidemic

por Eudes Filho, João, dos Santos, Isabele Barbieri, Reis, Carmélia Matos Santiago, Patané, José Salvatore Leister, Paredes, Verenice, Bernardes, João Paulo Romualdo Alarcão, Poggiani, Sabrina dos Santos Costa, Castro, Talita de Cássia Borges, Gomez, Oscar Mauricio, Pereira, Sandro Antonio, Schubach, Edvar Yuri Pacheco, Gomes, Kamila Peres, Mavengere, Heidi, Alves, Lucas Gomes de Brito, Lucas, Joaquim, Paes, Hugo Costa, Albuquerque, Patrícia, Cruz, Laurício Monteiro, McEwen, Juan G., Stajich, Jason E., Almeida-Paes, Rodrigo, Zancopé-Oliveira, Rosely Maria, Matute, Daniel R., Barker, Bridget M., Felipe, Maria Sueli Soares, Teixeira, Marcus de Melo, Nicola, André Moraes
Publicado 2020

Genomic monitoring of the SARS-CoV-2 B1.1.7 (WHO VOC Alpha) in the Sao Paulo state, Brazil

por Slavov, Svetoslav Nanev, Bezerra, Rafael dos Santos, Rodrigues, Evandra Strazza, Santos, Elaine Vieira, Borges, Joseane Serrano, de la Roque, Débora Glenda Lima, Patané, José Salvatore Leister, Lima, Alex Ranieri Jerônimo, Ribeiro, Gabriela, Viala, Vincent Louis, de Lima, Loyze Paola Oliveira, Martins, Antonio Jorge, dos Santos Barros, Claudia Renata, Marqueze, Elaine Cristina, Bernardino, Jardelina de Souza Todão, Moretti, Debora Botequio, Brassaloti, Ricardo Augusto, Cassano, Raquel de Lello Rocha Campos, Mariani, Pilar Drummond Sampaio Corrêa, Kitajima, João Paulo, Santos, Bibiana, Assato, Patricia Akemi, da Silva da Costa, Felipe Allan, Poleti, Mirele Daiana, Lesbon, Jessika Cristina Chagas, Mattos, Elisangela Chicaroni, Banho, Cecilia Artico, Sacchetto, Lívia, Moraes, Marília Mazzi, Grotto, Rejane Maria Tommasini, Souza-Neto, Jayme A., Giovanetti, Marta, de Alcantara, Luiz Carlos Junior, Nogueira, Maurício Lacerda, Fukumasu, Heidge, Coutinho, Luiz Lehmann, Calado, Rodrigo Tocantins, Neto, Raul Machado, Covas, Dimas Tadeu, Coccuzzo Sampaio, Sandra, Elias, Maria Carolina, Kashima, Simone
Publicado 2022

Nucleocapsid (N) Gene Mutations of SARS-CoV-2 Can Affect Real-Time RT-PCR Diagnostic and Impact False-Negative Results

por Lesbon, Jéssika Cristina Chagas, Poleti, Mirele Daiana, de Mattos Oliveira, Elisângela Chicaroni, Patané, José Salvatore Leister, Clemente, Luan Gaspar, Viala, Vincent Louis, Ribeiro, Gabriela, Giovanetti, Marta, de Alcantara, Luiz Carlos Junior, Teixeira, Olivia, Nonato, Maria Cristina, de Lima, Loyze Paola Oliveira, Martins, Antonio Jorge, dos Santos Barros, Claudia Renata, Marqueze, Elaine Cristina, de Souza Todão Bernardino, Jardelina, Moretti, Debora Botequio, Brassaloti, Ricardo Augusto, de Lello Rocha Campos Cassano, Raquel, Mariani, Pilar Drummond Sampaio Correa, Slavov, Svetoslav Nanev, dos Santos, Rafael Bezerra, Rodrigues, Evandra Strazza, Santos, Elaine Vieira, Borges, Josiane Serrano, de La Roque, Debora Glenda Lima, Kitajima, Joao Paulo, Santos, Bibiana, Assato, Patricia Akemi, da Silva da Costa, Felipe Allan, Banho, Cecilia Artico, Sacchetto, Livia, Moraes, Marilia Mazzi, Palmieri, Melissa, da Silva, Fabiana Erica Vilanova, Grotto, Rejane Maria Tommasini, Souza-Neto, Jayme A., Nogueira, Mauricio Lacerda, Coutinho, Luiz Lehman, Calado, Rodrigo Tocantins, Neto, Raul Machado, Covas, Dimas Tadeu, Kashima, Simone, Elias, Maria Carolina, Sampaio, Sandra Coccuzzo, Fukumasu, Heidge
Publicado 2021

Correction: Lesbon et al. Nucleocapsid (N) Gene Mutations of SARS-CoV-2 Can Affect Real-Time RT-PCR Diagnostic and Impact False-Negative Results. Viruses 2021, 13, 2474

por Lesbon, Jéssika Cristina Chagas, Poleti, Mirele Daiana, de Mattos Oliveira, Elisângela Chicaroni, Patané, José Salvatore Leister, Clemente, Luan Gaspar, Viala, Vincent Louis, Ribeiro, Gabriela, Giovanetti, Marta, de Alcantara, Luiz Carlos Junior, Teixeira, Olivia, Nonato, Maria Cristina, de Lima, Loyze Paola Oliveira, Martins, Antonio Jorge, dos Santos Barros, Claudia Renata, Marqueze, Elaine Cristina, de Souza Todão Bernardino, Jardelina, Moretti, Debora Botequio, Brassaloti, Ricardo Augusto, de Lello Rocha Campos Cassano, Raquel, Mariani, Pilar Drummond Sampaio Correa, Slavov, Svetoslav Nanev, dos Santos, Rafael Bezerra, Rodrigues, Evandra Strazza, Santos, Elaine Vieira, Borges, Josiane Serrano, de La Roque, Debora Glenda Lima, Kitajima, Joao Paulo, Santos, Bibiana, Assato, Patricia Akemi, da Silva da Costa, Felipe Allan, Banho, Cecilia Artico, Sacchetto, Livia, Moraes, Marilia Mazzi, Palmieri, Melissa, da Silva, Fabiana Erica Vilanova, Grotto, Rejane Maria Tommasini, Souza-Neto, Jayme A., Nogueira, Mauricio Lacerda, Coutinho, Luiz Lehman, Calado, Rodrigo Tocantins, Neto, Raul Machado, Covas, Dimas Tadeu, Kashima, Simone, Elias, Maria Carolina, Sampaio, Sandra Coccuzzo, Fukumasu, Heidge
Publicado 2022

Genomic epidemiology of the SARS-CoV-2 epidemic in Brazil

por Giovanetti, Marta, Slavov, Svetoslav Nanev, Fonseca, Vagner, Wilkinson, Eduan, Tegally, Houriiyah, Patané, José Salvatore Leister, Viala, Vincent Louis, San, Emmanuel James, Rodrigues, Evandra Strazza, Santos, Elaine Vieira, Aburjaile, Flavia, Xavier, Joilson, Fritsch, Hegger, Adelino, Talita Emile Ribeiro, Pereira, Felicidade, Leal, Arabela, Iani, Felipe Campos de Melo, de Carvalho Pereira, Glauco, Vazquez, Cynthia, Sanabria, Gladys Mercedes Estigarribia, Oliveira, Elaine Cristina de, Demarchi, Luiz, Croda, Julio, dos Santos Bezerra, Rafael, Paola Oliveira de Lima, Loyze, Martins, Antonio Jorge, Renata dos Santos Barros, Claudia, Marqueze, Elaine Cristina, de Souza Todao Bernardino, Jardelina, Moretti, Debora Botequio, Brassaloti, Ricardo Augusto, de Lello Rocha Campos Cassano, Raquel, Mariani, Pilar Drummond Sampaio Corrêa, Kitajima, João Paulo, Santos, Bibiana, Proto-Siqueira, Rodrigo, Cantarelli, Vlademir Vicente, Tosta, Stephane, Nardy, Vanessa Brandão, Reboredo de Oliveira da Silva, Luciana, Gómez, Marcela Kelly Astete, Lima, Jaqueline Gomes, Ribeiro, Adriana Aparecida, Guimarães, Natália Rocha, Watanabe, Luiz Takao, Barbosa Da Silva, Luana, da Silva Ferreira, Raquel, da Penha, Mara Patricia F., Ortega, María José, de la Fuente, Andrea Gómez, Villalba, Shirley, Torales, Juan, Gamarra, María Liz, Aquino, Carolina, Figueredo, Gloria Patricia Martínez, Fava, Wellington Santos, Motta-Castro, Ana Rita C., Venturini, James, do Vale Leone de Oliveira, Sandra Maria, Gonçalves, Crhistinne Cavalheiro Maymone, do Carmo Debur Rossa, Maria, Becker, Guilherme Nardi, Giacomini, Mayra Presibella, Marques, Nelson Quallio, Riediger, Irina Nastassja, Raboni, Sonia, Mattoso, Gabriela, Cataneo, Allan D., Zanluca, Camila, Duarte dos Santos, Claudia N., Assato, Patricia Akemi, Allan da Silva da Costa, Felipe, Poleti, Mirele Daiana, Lesbon, Jessika Cristina Chagas, Mattos, Elisangela Chicaroni, Banho, Cecilia Artico, Sacchetto, Lívia, Moraes, Marília Mazzi, Grotto, Rejane Maria Tommasini, Souza-Neto, Jayme A., Nogueira, Maurício Lacerda, Fukumasu, Heidge, Coutinho, Luiz Lehmann, Calado, Rodrigo Tocantins, Neto, Raul Machado, Bispo de Filippis, Ana Maria, Venancio da Cunha, Rivaldo, Freitas, Carla, Peterka, Cassio Roberto Leonel, de Fátima Rangel Fernandes, Cássia, Navegantes, Wildo, do Carmo Said, Rodrigo Fabiano, Campelo de A e Melo, Carlos F., Almiron, Maria, Lourenço, José, de Oliveira, Tulio, Holmes, Edward C., Haddad, Ricardo, Sampaio, Sandra Coccuzzo, Elias, Maria Carolina, Kashima, Simone, Junior de Alcantara, Luiz Carlos, Covas, Dimas Tadeu
Publicado 2022

Genomic epidemiology reveals the impact of national and international restrictions measures on the SARS-CoV-2 epidemic in Brazil

por Giovanetti, Marta, Slavov, Svetoslav Nanev, Fonseca, Vagner, Wilkinson, Eduan, Tegally, Houriiyah, Patané, José Salvatore Leister, Viala, Vincent Louis, San, James Emmanuel, Rodrigues, Evandra Strazza, Santos, Elaine Vieira, Aburjaile, Flavia, Xavier, Joilson, Fritsch, Hegger, Adelino, Talita Emile Ribeiro, Pereira, Felicidade, Leal, Arabela, de Melo Iani, Felipe Campos, de Carvalho Pereira, Glauco, Vazquez, Cynthia, Mercedes Estigarribia Sanabria, Gladys, de Oliveira, Elaine Cristina, Demarchi, Luiz, Croda, Julio, dos Santos Bezerra, Rafael, de Lima, Loyze Paola Oliveira, Martins, Antonio Jorge, dos Santos Barros, Claudia Renata, Marqueze, Elaine Cristina, de Souza Todao Bernardino, Jardelina, Moretti, Debora Botequio, Brassaloti, Ricardo Augusto, de Lello Rocha Campos Cassano, Raquel, Mariani, Pilar Drummond Sampaio Corrêa, Kitajima, João Paulo, Santos, Bibiana, Proto-Siqueira, Rodrigo, Cantarelli, Vlademir Vicente, Tosta, Stephane, Nardy, Vanessa Brandão, de Oliveira da Silva, Luciana Reboredo, Kelly Astete Gómez, Marcela, Lima, Jaqueline Gomes, Ribeiro, Adriana Aparecida, Guimarães, Natália Rocha, Watanabe, Luiz Takao, Da Silva, Luana Barbosa, da Silva Ferreira, Raquel, da Penha, Mara Patricia F., Ortega, María José, de la Fuente, Andrea Gómez, Villalba, Shirley, Torales, Juan, Gamarra, María Liz, Aquino, Carolina, Martínez Figueredo, Gloria Patricia, Fava, Wellington Santos, Motta-Castro, Ana Rita C., Venturini, James, de Oliveira, Sandra Maria do Vale Leone, Gonçalves, Crhistinne Cavalheiro Maymone, do Carmo Debur Rossa, Maria, Becker, Guilherme Nardi, Presibella, Mayra Marinho, Marques, Nelson Quallio, Riediger, Irina Nastassja, Raboni, Sonia, Coelho, Gabriela Mattoso, Cataneo, Allan Henrique Depieri, Zanluca, Camila, dos Santos, Claudia N Duarte, Assato, Patricia Akemi, da Costa, Felipe Allan da Silva, Poleti, Mirele Daiana, Lesbon, Jessika Cristina Chagas, Mattos, Elisangela Chicaroni, Banho, Cecilia Artico, Sacchetto, Lívia, Moraes, Marília Mazzi, Grotto, Rejane Maria Tommasini, Souza-Neto, Jayme A., Nogueira, Maurício Lacerda, Fukumasu, Heidge, Coutinho, Luiz Lehmann, Calado, Rodrigo Tocantins, Neto, Raul Machado, de Filippis, Ana Maria Bispo, da Cunha, Rivaldo Venancio, Freitas, Carla, Peterka, Cassio Roberto Leonel, de Fátima Rangel Fernandes, Cássia, de Araújo, Wildo Navegantes, do Carmo Said, Rodrigo Fabiano, Almiron, Maria, de Albuquerque e Melo, Carlos Frederico Campelo, Lourenço, José, de Oliveira, Tulio, Holmes, Edward C., Haddad, Ricardo, Sampaio, Sandra Coccuzzo, Elias, Maria Carolina, Kashima, Simone, de Alcantara, Luiz Carlos Junior, Covas, Dimas Tadeu
Publicado 2022