Karissa Sanbonmatsu

La primera simulación de mil millones de átomos de un gen completo (GATA4). Karissa Y. Sanbonmatsu es una bióloga estructural estadounidense transgénero del Laboratorio Nacional de Los Álamos. Trabaja en el mecanismo de los complejos de ARN no codificante, incluidos el ribosoma, los riboswitches, los ARN largos no codificantes y la cromatina. Fue la primera persona en realizar una simulación atomística del ribosoma, determinar la estructura secundaria de un lncRNA intacto y publicar una simulación de mil millones de átomos de un complejo biomolecular. proporcionado por Wikipedia
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    por Sanbonmatsu, Karissa
    Publicado 2021
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    Getting to the bottom of lncRNA mechanism: structure–function relationships
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    Tertiary contacts control switching of the SAM-I riboswitch
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    Tools for the cryo-EM gold rush: going from the cryo-EM map to the atomistic model
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    Structural architecture of the human long non-coding RNA, steroid receptor RNA activator
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    Sizing up long non-coding RNAs: Do lncRNAs have secondary and tertiary structure?
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    The expression platform and the aptamer: cooperativity between Mg(2+) and ligand in the SAM-I riboswitch
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    Tackling Structures of Long Noncoding RNAs
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    Geometric alignment of aminoacyl-tRNA relative to catalytic centers of the ribosome underpins accurate mRNA decoding
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    SMOG@ctbp: simplified deployment of structure-based models in GROMACS
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    Connecting the Kinetics and Energy Landscape of tRNA Translocation on the Ribosome
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    Stringent Nucleotide Recognition by the Ribosome at the Middle Codon Position
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    Magnesium controls aptamer-expression platform switching in the SAM-I riboswitch
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    Quantitative comparison between sub-millisecond time resolution single-molecule FRET measurements and 10-second molecular simulations of a biosensor protein
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    Tracking fluctuation hotspots on the yeast ribosome through the elongation cycle
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    Improved quality metrics for association and reproducibility in chromatin accessibility data using mutual information
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    Polymer modelling accurately predicts three-dimensional chromosome reorganization with a seasonal coronavirus infection
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    Integrative structural studies of the SARS-CoV-2 spike protein during the fusion process (2022)
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    A magnesium-induced triplex pre-organizes the SAM-II riboswitch
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    Zinc-finger protein CNBP alters the 3-D structure of lncRNA Braveheart in solution
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    Elongation factor-Tu can repetitively engage aminoacyl-tRNA within the ribosome during the proofreading stage of tRNA selection
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