Protocols for extraction of total RNA from pecan nut (Carya illinoinensis [Wangenh.] K. Koch) embryo tissue

Introduction: Gene expression studies require extraction protocols that allow obtaining high quality RNA, especially when working with tissues rich in polysaccharides, lipids and polyphenols such as pecan nut (Carya illinoinensis [Wangenh.] K. Koch) embryo tissue.Objective: To evaluate the efficienc...

Descripción completa

Detalles Bibliográficos
Autores principales: Rodríguez-González, Mayela, Arreola-Ávila, Jesús G., Ávila-Rodríguez, Verónica, García-González, Fabian, Quezada-Rivera, Jesús J., Mota-Ituarte, María del S., Borja-de la Rosa, Amparo
Formato: Online Artículo
Lenguaje:spa
Publicado: Universidad Autónoma Chapingo 2022
Materias:
nogal pecanero
ácido ribonucleico
bromuro de cetiltrimetilamonio
polifenoles
PCR de transcripción inversa
La presencia de polifenoles y polisacáridos dificultan la extracción de ARN total de nuez pecanera.
Se evaluaron protocolos de extracción de ARN basados en TRI Reagent®, buffer CTAB y un kit comercial.
La calidad del ARN total varió de acuerdo con la eficiencia del método utilizado.
El reactivo TRI Reagent® permitió concentraciones altas de ARN total, pero contaminado.
El buffer CTAB garantizó la obtención y calidad de ARN total del tejido embrionario de nuez pecanera.
pecan nut
ribonucleic acid
cetyltrimethylammonium bromide
polyphenols
reverse transcription PCR
The presence of polyphenols and polysaccharides impede the extraction of total RNA from pecan nut.
RNA extraction protocols based on TRI Reagent®, CTAB buffer and a commercial kit were evaluated.
The quality of total RNA varied according to the efficiency of the method used.
The TRI Reagent® provided high but contaminated concentrations of total RNA.
The CTAB buffer provided high concentrations and quality of total RNA from pecan embryo tissue.
Acceso en línea:https://revistas.chapingo.mx/forestales/article/view/r.rchscfa.2022.08.057
https://dx.doi.org/10.5154/r.rchscfa.2022.08.057

Internet

https://revistas.chapingo.mx/forestales/article/view/r.rchscfa.2022.08.057
https://dx.doi.org/10.5154/r.rchscfa.2022.08.057

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