G-VOC : Étude de la gravité du variant gamma du SARS-CoV-2 comparé aux variants antérieurs (virus historique, alpha et zêta).

INTRODUCTION: La Guyane, du fait de sa situation géographique en Amérique du Sud et de ses liens avec hexagone, a été exposée à des vagues épidémiques de COVID-19 venant tantôt de l'Europe, tantôt du Brésil. Début 2021, le variant gamma arrivé du Brésil a très rapidement remplacé le virus historique, avec une morbi-mortalité apparente accrue. La gravité de ce variant a été peu étudiée en dehors du Brésil. L'objectif primaire de notre étude était de comparer la gravité clinique des patients COVID-19 dus au variant gamma aux autres variants circulant en Guyane sur la même période. MATÉRIELS ET MÉTHODES: Une étude rétrospective multicentrique a été réalisée sur la période de janvier à avril 2021, porte sur les patients infectés par SARS-CoV-2 qui ont bénéficié d'un séquençage. Les patients non joignables et non consentants n'ont été inclus. Les données sociodémographiques et cliniques ont été recueillies. Le critère de jugement principal était le décès et les critères secondaires comprenaient l'hospitalisation, le séjour en réanimation et le besoin d'une oxygénothérapie. Les patients infectés par le variant gamma (20J/501Y.V3) ont été comparés aux autres variants regroupés: virus historique (19B, 20A, 20A.EU2 et 20E (EU1)), variant alpha (20I/501Y.V1) et variant zêta (20B/P2-484K). Les variables continues ont été comparées en utilisant le test de Student et les variables catégorielles en utilisant le test exact de Fischer. Les résultats exprimés en p (seuil de significativité < 0,05; Odds Ratio brut et intervalle de confiance à 95%). Une hospitalisation était définie comme un séjour à l'hôpital ≥2 nuits. RÉSULTATS: Parmi les 380 patients éligibles, 339 patients ont été inclus dans l'étude et 41 non inclus, (5 non joignables et 36 refus). L'âge moyen était de 39.2±17.7 ans, 48.7% étaient des femmes et 20.7% avaient au moins une comorbidité. Cinquante patients ont été hospitalisés (14.7%) dont 16 en réanimation (4.7%) et 9 (2.7%) sont décédés. On ne retrouvait pas de différence d'âge significative entre les 2 groupes, ni de fréquence de l'HTA, du diabète, ou d'autres comorbidités. Les patients infectés par le gamma ont été plus souvent hospitalisés que le groupe témoin (20.6% vs 10.4%; p 0.01; OR 2.2 (1.2-4.4) et ont plus souvent eu besoin de l'oxygénothérapie (11.6% vs 2.6%, p 0.01; OR 4.9 (1.7-17.5). Il n'y avait pas de différence significative en termes d'oxygénation invasive (haut débit ou intubation) (4.8% vs 2.6%; p 0.21), d'hospitalisation en réanimation (6.9% vs 3.1%; p 0.12), ou de décès (3.4% vs 2.1%; p 0.5). CONCLUSION: Le variant gamma ne semble pas avoir entrainé une plus forte mortalité liée au Covid-19 en comparaison aux autres variants circulant en Guyane à la même période dans le contexte particulier de la Guyane (population jeune et faiblement pré-exposée au virus). Cependant, on a observé plus d'hospitalisation et d'oxygénorquérance dans le groupe gamma. L'absence de recrutement des cas de Covid-19 non hospitalier est aussi à prendre en compte. D'autres études sur des effectifs plus importants sont nécessaires pour confirmer ou infirmer ces différences. Aucun lien d'intérêt