Évaluation quantitative de l'exhaustivité des systèmes de surveillance de la Covid-19: des défis majeurs, des progrès nécessaires

INTRODUCTION: La surveillance de la Covid19 en France et notamment celle des formes graves admises en réanimation a nécessité l'instauration en urgence de systèmes de surveillance à visée exhaustive dès mars 2020. Notre objectif a été d'estimer le nombre total d'admissions pour COVID-19 en réanimation au cours de la seconde vague de la Covid19 (décembre 2020- janvier 2021) ainsi que les taux d'exhaustivité des systèmes de surveillance des formes graves. MATÉRIELS ET MÉTHODES: L'adaptation en urgence du Système d'information pour le suivi des victimes d'attentats et situations sanitaires exceptionnelles (SIVIC) et du dispositif de surveillance sentinelle en réanimation (SCG) a été capitale pour suivre l'impact de la pandémie. En effet, le programme de médicalisation des systèmes d'information (PMSI) n'est pas disponible en temps réel. Un algorithme itératif a été développé afin d'identifier les patients communs aux 3 bases avec différents seuils de similarité testés par des analyses de sensibilité. Des modèles log-linéaire de capture-recapture 3 sources ont été appliqués afin d'estimer le nombre d'admissions sur la période du 2 décembre 2020 au 31 janvier 2021. RÉSULTATS: Avant croisement entre les 3 bases de données, nous avons identifié 2 235 cas rapportés par SCG, 7213 par le PMSI et 7549 par SIVIC. Une corrélation entre les 3 bases, du nombre de cas quotidien admis en réanimation, a été mise en évidence. Après croisement, 9478 cas admis en réanimation ont été identifiés dans au moins une base de données; dont 3518 dans seulement une base et 1 559 patients dans les 3 bases. L'obtention d'un estimateur sans biais du nombre total de cas par la méthode de capture-recapture a été limité par la mise en évidence de dépendances entre les 3 bases de données et d'une hétérogénéité individuelle d'identification des cas. Seule la borne inférieure de l'intervalle de confiance à 95% du nombre total de cas a ainsi pu être estimé à 11266 cas et seule la borne supérieure de l'IC95% du taux d'exhaustivité a pu être calculé: 68,7% pour SI-VIC, 65,6% pour le PMSI et 20,3% pour la surveillance sentinelle. CONCLUSION: Notre étude décrit des performances comparables entre les bases de données COVID-19 sur le suivi en temps réel de la dynamique épidémique des cas sévères et met en évidence une exhaustivité maximale sub-optimale (<70%) pour les trois bases de données étudiées. Les difficultés rencontrées dans l'application de la méthode de capture-recapture trois sources soulignent des limites inhérentes aux bases de données nationales COVID-19 concernant les possibilités de croisement en l'absence du recueil d'un numéro d'identification unique des personnes et identifie des pistes d'amélioration pour le développement de futurs systèmes d'information. Aucun lien d'intérêt