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ProteoClade: A taxonomic toolkit for multi-species and metaproteomic analysis
We present ProteoClade, a Python toolkit that performs taxa-specific peptide assignment, protein inference, and quantitation for multi-species proteomics experiments. ProteoClade scales to hundreds of millions of protein sequences, requires minimal computational resources, and is open source, multi-...
Autores principales: | Mooradian, Arshag D., van der Post, Sjoerd, Naegle, Kristen M., Held, Jason M. |
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Formato: | Online Artículo Texto |
Lenguaje: | English |
Publicado: |
Public Library of Science
2020
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Materias: | |
Acceso en línea: | https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC7082058/ https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/32150535 http://dx.doi.org/10.1371/journal.pcbi.1007741 |
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