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Discriminer la COVID-19 et la dengue des autres maladies fébriles dans le contexte d’une co-épidémie en zone tropicale : développement et validation interne des scores COVIDENGUE
INTRODUCTION: L’infection par le coronavirus 2019 (COVID-19) et la dengue sont difficiles à différencier cliniquement dans le contexte des co-épidémies en zone tropicale. Dans une étude de cohorte rétrospective, nous avons précédemment distingué les facteurs associés au coronavirus 2019 (COVID-19) e...
Autores principales: | , , , , , , , |
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Formato: | Online Artículo Texto |
Lenguaje: | English |
Publicado: |
Published by Elsevier Masson SAS
2021
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Materias: | |
Acceso en línea: | https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC8138908/ http://dx.doi.org/10.1016/j.respe.2021.04.006 |
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author | Levin, C. Andry, F. Bruneau, L. Joubert, A. Accot, F. Maillard, O. Bertolotti, A. Gérardin, P. |
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description | INTRODUCTION: L’infection par le coronavirus 2019 (COVID-19) et la dengue sont difficiles à différencier cliniquement dans le contexte des co-épidémies en zone tropicale. Dans une étude de cohorte rétrospective, nous avons précédemment distingué les facteurs associés au coronavirus 2019 (COVID-19) et à la dengue de ceux associés à d’autres maladies fébriles (OFI). L’objectif de cette nouvelle analyse était de développer un score pour discriminer les deux infections à leur présentation. MÉTHODES: Les facteurs associés aux deux infections ont été identifiés à l’aide de modèles de régression logistique multinomiale (OFI pris comme sujets contrôles) parmi tous les sujets suspects de la COVID-19 ayant fréquenté le centre de dépistage du coronavirus de type 2 (SRAS-CoV-2) de l’hôpital universitaire de Saint-Pierre, île de La Réunion, entre le 23 mars et 10 mai 2020. Deux scores COVIDENGUE ont été développés et validés en interne par bootstrapping pour prédire chaque infection après pondération des odd ratios selon une règle prédéfinie. Le pouvoir discriminant de chaque score a été évalué à l’aide des aires sous la courbe ROC (« receiver operating characteristic curve »). Leur calibration a été évaluée à l’aide du test d’adéquation modifié d’Hosmer–Lemeshow pour les variables dépendantes polytomiques. RÉSULTATS: Sur les deux mois de la période d’étude, 80 cas de COVID-19, 60 cas de dengue non sévères et 872 cas d’OFI ont été diagnostiqués. Les scores COVIDENGUE étaient composés de 11 critères : contact avec un cas positif de COVID-19 (+3 points pour COVID-19 ; 0 point pour la dengue), retour de voyage à l’étranger dans les 15 jours précédents (+3 ; −1), antécédents de dengue (+1 ; +3), tabagisme actif (−3 ; 0), courbatures (0 ; +5), toux (0 ; −2), symptômes d’infection des voies respiratoires supérieures (−1 ; −1), anosmie (+7 ; −1), maux de tête (0 ; +5), douleur rétro-orbitaire (−1 ; +5) et présentation tardive (> 3 jours) à l’hôpital (+1 ; 0). L’aire sous la courbe ROC était de 0,79 (IC95 % : 0,76–0,82) pour la COVID-19 et de 0,88 (IC95 % : 0,85–0,90) pour la dengue. La calibration était satisfaisante pour les deux scores (valeurs de p du Chi(2) du Goodness-of-Fit à 0,94 et 0,55, respectivement). Pour la COVID-19, la sensibilité était de 97 % au seuil de 0 point et la spécificité de 99 % au seuil de 10 points. Pour la dengue, la sensibilité était de 93 % au seuil de 2 points et la spécificité de 94 % au seuil de 10 points. CONCLUSION: Les scores COVIDENGUE sont des outils discriminants pour distinguer la COVID-19 et la dengue des autres maladies fébriles dans le contexte d’une co-épidémie à l’île de La Réunion. D’autres études sont nécessaires pour valider ou affiner ces scores dans d’autres contextes épidémiques pour la COVID-19 (selon, par exemple, le niveau de circulation des nouveaux variants) ou d’endémie pour la dengue (selon, par exemple, les proportions de dengues primaires et de dengues secondaires), ces situations épidémiologiques pouvant modifier la présentation clinique de ces deux affections. |
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id | pubmed-8138908 |
institution | National Center for Biotechnology Information |
language | English |
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spelling | pubmed-81389082021-05-21 Discriminer la COVID-19 et la dengue des autres maladies fébriles dans le contexte d’une co-épidémie en zone tropicale : développement et validation interne des scores COVIDENGUE Levin, C. Andry, F. Bruneau, L. Joubert, A. Accot, F. Maillard, O. Bertolotti, A. Gérardin, P. Rev Epidemiol Sante Publique 1.4 INTRODUCTION: L’infection par le coronavirus 2019 (COVID-19) et la dengue sont difficiles à différencier cliniquement dans le contexte des co-épidémies en zone tropicale. Dans une étude de cohorte rétrospective, nous avons précédemment distingué les facteurs associés au coronavirus 2019 (COVID-19) et à la dengue de ceux associés à d’autres maladies fébriles (OFI). L’objectif de cette nouvelle analyse était de développer un score pour discriminer les deux infections à leur présentation. MÉTHODES: Les facteurs associés aux deux infections ont été identifiés à l’aide de modèles de régression logistique multinomiale (OFI pris comme sujets contrôles) parmi tous les sujets suspects de la COVID-19 ayant fréquenté le centre de dépistage du coronavirus de type 2 (SRAS-CoV-2) de l’hôpital universitaire de Saint-Pierre, île de La Réunion, entre le 23 mars et 10 mai 2020. Deux scores COVIDENGUE ont été développés et validés en interne par bootstrapping pour prédire chaque infection après pondération des odd ratios selon une règle prédéfinie. Le pouvoir discriminant de chaque score a été évalué à l’aide des aires sous la courbe ROC (« receiver operating characteristic curve »). Leur calibration a été évaluée à l’aide du test d’adéquation modifié d’Hosmer–Lemeshow pour les variables dépendantes polytomiques. RÉSULTATS: Sur les deux mois de la période d’étude, 80 cas de COVID-19, 60 cas de dengue non sévères et 872 cas d’OFI ont été diagnostiqués. Les scores COVIDENGUE étaient composés de 11 critères : contact avec un cas positif de COVID-19 (+3 points pour COVID-19 ; 0 point pour la dengue), retour de voyage à l’étranger dans les 15 jours précédents (+3 ; −1), antécédents de dengue (+1 ; +3), tabagisme actif (−3 ; 0), courbatures (0 ; +5), toux (0 ; −2), symptômes d’infection des voies respiratoires supérieures (−1 ; −1), anosmie (+7 ; −1), maux de tête (0 ; +5), douleur rétro-orbitaire (−1 ; +5) et présentation tardive (> 3 jours) à l’hôpital (+1 ; 0). L’aire sous la courbe ROC était de 0,79 (IC95 % : 0,76–0,82) pour la COVID-19 et de 0,88 (IC95 % : 0,85–0,90) pour la dengue. La calibration était satisfaisante pour les deux scores (valeurs de p du Chi(2) du Goodness-of-Fit à 0,94 et 0,55, respectivement). Pour la COVID-19, la sensibilité était de 97 % au seuil de 0 point et la spécificité de 99 % au seuil de 10 points. Pour la dengue, la sensibilité était de 93 % au seuil de 2 points et la spécificité de 94 % au seuil de 10 points. CONCLUSION: Les scores COVIDENGUE sont des outils discriminants pour distinguer la COVID-19 et la dengue des autres maladies fébriles dans le contexte d’une co-épidémie à l’île de La Réunion. D’autres études sont nécessaires pour valider ou affiner ces scores dans d’autres contextes épidémiques pour la COVID-19 (selon, par exemple, le niveau de circulation des nouveaux variants) ou d’endémie pour la dengue (selon, par exemple, les proportions de dengues primaires et de dengues secondaires), ces situations épidémiologiques pouvant modifier la présentation clinique de ces deux affections. Published by Elsevier Masson SAS 2021-06 2021-05-21 /pmc/articles/PMC8138908/ http://dx.doi.org/10.1016/j.respe.2021.04.006 Text en Copyright © 2021 Published by Elsevier Masson SAS. Since January 2020 Elsevier has created a COVID-19 resource centre with free information in English and Mandarin on the novel coronavirus COVID-19. The COVID-19 resource centre is hosted on Elsevier Connect, the company's public news and information website. Elsevier hereby grants permission to make all its COVID-19-related research that is available on the COVID-19 resource centre - including this research content - immediately available in PubMed Central and other publicly funded repositories, such as the WHO COVID database with rights for unrestricted research re-use and analyses in any form or by any means with acknowledgement of the original source. These permissions are granted for free by Elsevier for as long as the COVID-19 resource centre remains active. |
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