Séroprévalence SARS-CoV-2 au Mali : résultats d’une enquête transversale

INTRODUCTION: Le Mali, comme beaucoup de pays d’Afrique sub-saharienne, n’a rapporté jusqu’à présent qu’un nombre limité de cas de COVID-19. Le nombre total de décès déclarés reste faible. En septembre 2020, on dénombrait 1532 cas et 81 décès sur la ville de Bamako, dont 466 cas et 27 décès dans la commune VI. Cette étude évalue la proportion de la population ayant été infectée par le SARS-CoV-2 à Bamako et la compare aux données rapportées afin d’éclairer l’épidémie de COVID-19 au Mali. MATÉRIELS ET MÉTHODES: L’étude a eu lieu dans 3 quartiers de la commune VI de Bamako. Un échantillonnage stratifié par quartiers et secteurs a permis de tirer au sort des concessions, dans lesquelles tous les ménages acceptant de participer ont été inclus. Les participants ont été inclus à leur domicile, répondu à un questionnaire et fourni un échantillon sanguin. Les anticorps IgM et IgG contre la protéine Spike du SARS-CoV-2 ont été détectés par ELISA. La séroprévalence et l’intervalle de confiance à 95 % (IC95 %) ont été calculés pour la commune VI, par quartier, par classe d’âge. Le nombre total d’infections survenues à Bamako a été estimé en appliquant les taux de séroprévalence mesurés par âge et par sexe à la population de Bamako (données de recensement de 2009 actualisées en 2017). Le nombre de décès attendus a été calculé en appliquant aux infections estimées les taux de mortalité par classe d’âge observés en Chine durant la phase précoce de l’épidémie (alors que la prise en charge n’avait pas été optimisée). RÉSULTATS: Du 16 au 29 septembre 2020, 1526 participants ont été inclus et 1367 résultats valides de sérologie obtenus. La séroprévalence brute s’élevait à 16,5 % (225/1367, IC95 % = 14,5–18,5 %). La prévalence était similaire entre les 3 quartiers (Chi(2), p = 0,91). Une tendance non significative à l’augmentation avec l’âge a été observée. En tenant compte de la distribution par âge et par sexe de l’échantillon par rapport à celle de la population, la prévalence en population générale était estimée à 15,8 %, soit plus de 380 000 infections pour 2,4 millions d’habitants. Le nombre attendu de décès liés à la COVID-19 serait inférieur à 1500 entre mars et septembre 2020 à Bamako. CONCLUSION: Cette étude transversale suggère une propagation lente mais généralisée du SARS-CoV-2 durant les 6 premiers mois de la pandémie à Bamako. La faible mortalité rapportée ne reflète pas les décès attendus, mais la létalité estimée reste faible (< 4 décès/1000 cas), en accord avec la structure jeune de la population. Une enquête similaire à Tombouctou est en cours d’analyse.