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241por Ding, Honglei, Gong, Siqi, Tian, Yingxin, Yang, Zhangsheng, Brunham, Robert, Zhong, Guangming“…Using blasticidin for selection, stable transformants were obtained. The GFP-BSD fusion protein was detected in cultures infected with the pGFPBSD/Z::SW2-trasnformed serovar D organisms. …”
Publicado 2013
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242
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243“…CONCLUSIONS: TopHat-Recondition can repair unmapped read files written by TopHat and is freely available under a 2-clause BSD license on GitHub: https://github.com/cbrueffer/tophat-recondition. …”
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244“…AVAILABILITY AND IMPLEMENTATION: LeNup is freely available as Python and Lua script source code under a BSD style license from https://github.com/biomedBit/LeNup. …”
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245“…Both fragments contain only a portion of the ura4 or bsdMX marker so that only the correctly assembled plasmid can confer uracil prototrophy or blasticidin resistance. …”
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246por Bokulich, Nicholas A., Dillon, Matthew R., Zhang, Yilong, Rideout, Jai Ram, Bolyen, Evan, Li, Huilin, Albert, Paul S., Caporaso, J. Gregory“…The q2-longitudinal package (https://github.com/qiime2/q2-longitudinal) is open-source software released under a 3-clause Berkeley Software Distribution (BSD) license and is freely available, including for commercial use. …”
Publicado 2018
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247por Brown, C. Titus, Moritz, Dominik, O’Brien, Michael P., Reidl, Felix, Reiter, Taylor, Sullivan, Blair D.“…Our software implementation is available at https://github.com/spacegraphcats/spacegraphcatsunder the 3-Clause BSD License.…”
Publicado 2020
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248por Hess, Matthew C., Collins, Christine S., Mabry, Scott E., Hicks, James W., Levitt, Eli B., Rajaram, SakthivelEnlace del recurso
Publicado 2021
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249por Palermo, Gisele Cristina de Lima, Coutouné, Natalia, Bueno, João Gabriel Ribeiro, Maciel, Lucas Ferreira, dos Santos, Leandro Vieira“…Our results indicated the vacuolar Fe(2+)/Mn(2+) transporter CCC1, and the protein involved in heavy metal ion homeostasis BSD2, as promising new targets for rational metabolic engineering strategies, enhancing xylose consumption in nine and 2.3‐fold compared with control. …”
Publicado 2021
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250por Smith, Jason P, Corces, M Ryan, Xu, Jin, Reuter, Vincent P, Chang, Howard Y, Sheffield, Nathan C“…PEPATAC is a robust and portable first step for any ATAC-seq project. BSD2-licensed code and documentation are available at https://pepatac.databio.org.…”
Publicado 2021
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251“…ActionPytential is available for all major platforms (Windows, MacOS, GNU + Linux, BSD).…”
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252“…Availability and implementation: Source code is available under a BSD license from http://sourceforge.net/projects/text2genome/ and results can be browsed and downloaded at http://text2genome.org. …”
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253“…Availability: The BioContext pipeline is available for download (under the BSD license) at http://www.biocontext.org, along with the extracted data which is also available for online browsing. …”
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254“…It is freely available under the BSD licence. The script source can be downloaded from http://sourceforge.net/p/rmol-toolset.…”
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255“…SynChro is freely available under the BSD license at http://www.lcqb.upmc.fr/CHROnicle/SynChro.html.…”
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256“…CONCLUSIONS: Source code and example programs are available under a BSD license at http://mlid.cps.cmich.edu/eickh1jl/tools/PCPML/. …”
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257por Crusoe, Michael R., Alameldin, Hussien F., Awad, Sherine, Boucher, Elmar, Caldwell, Adam, Cartwright, Reed, Charbonneau, Amanda, Constantinides, Bede, Edvenson, Greg, Fay, Scott, Fenton, Jacob, Fenzl, Thomas, Fish, Jordan, Garcia-Gutierrez, Leonor, Garland, Phillip, Gluck, Jonathan, González, Iván, Guermond, Sarah, Guo, Jiarong, Gupta, Aditi, Herr, Joshua R., Howe, Adina, Hyer, Alex, Härpfer, Andreas, Irber, Luiz, Kidd, Rhys, Lin, David, Lippi, Justin, Mansour, Tamer, McA'Nulty, Pamela, McDonald, Eric, Mizzi, Jessica, Murray, Kevin D., Nahum, Joshua R., Nanlohy, Kaben, Nederbragt, Alexander Johan, Ortiz-Zuazaga, Humberto, Ory, Jeramia, Pell, Jason, Pepe-Ranney, Charles, Russ, Zachary N., Schwarz, Erich, Scott, Camille, Seaman, Josiah, Sievert, Scott, Simpson, Jared, Skennerton, Connor T., Spencer, James, Srinivasan, Ramakrishnan, Standage, Daniel, Stapleton, James A., Steinman, Susan R., Stein, Joe, Taylor, Benjamin, Trimble, Will, Wiencko, Heather L., Wright, Michael, Wyss, Brian, Zhang, Qingpeng, zyme, en, Brown, C. Titus“…The khmer package is a freely available software library for working efficiently with fixed length DNA words, or k-mers. khmer provides implementations of a probabilistic k-mer counting data structure, a compressible De Bruijn graph representation, De Bruijn graph partitioning, and digital normalization. khmer is implemented in C++ and Python, and is freely available under the BSD license at https://github.com/dib-lab/khmer/.…”
Publicado 2015
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258por Sachs, Christian Carsten, Grünberger, Alexander, Helfrich, Stefan, Probst, Christopher, Wiechert, Wolfgang, Kohlheyer, Dietrich, Nöh, Katharina“…CONCLUSION: Presented is the software molyso, a ready-to-use open source software (BSD-licensed) for the unsupervised analysis of MM time-lapse image stacks. molyso source code and user manual are available at https://github.com/modsim/molyso.…”
Publicado 2016
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259por Ali, Raja H., Bark, Mikael, Miró, Jorge, Muhammad, Sayyed A., Sjöstrand, Joel, Zubair, Syed M., Abbas, Raja M., Arvestad, Lars“…CONCLUSIONS: VMCMC is a free software available under the New BSD License. Executable jar files, tutorial manual and source code can be downloaded from https://bitbucket.org/rhali/visualmcmc/. …”
Publicado 2017
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260“…We conduct experiments to benchmark the proposed algorithm with the other state-of-the-art ones on the Berkeley Segmentation Dataset (BSD) and remote sensing images. Results demonstrate that the SSLC algorithm yields the best overall performance, while the computation time-efficiency is still competitive.…”
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