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  1. 21
    “…Availability and implementation: Source and tutorials for MageComet are openly available at goo.gl/8LQPR under the GNU GPL v3 licenses. An implementation can be found at goo.gl/IdCuA Contact: parkinson@ebi.ac.uk or xue.vin@gmail.com…”
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    MageComet—web application for harmonizing existing large-scale experiment descriptions
  2. 22
    “…Availability: MicrobeDB is freely available under the GNU-GPL at: http://github.com/mlangill/microbedb/ Contact: morgan.g.i.langille@gmail.com…”
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    MicrobeDB: a locally maintainable database of microbial genomic sequences
  3. 23
    por de Almeida, João M.G.C.F.
    Publicado 2010
    “…id=2079 or https://sourceforge.net/projects/bidiblast/ under the GNU GPL license.…”
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    BiDiBlast: Comparative Genomics Pipeline for the PC
  4. 24
    por Diaz-Uriarte, Ramon
    Publicado 2017
    “…AVAILABILITY AND IMPLEMENTATION: Implemented in R and C ++, freely available from BioConductor for Linux, Mac and Windows under the GNU GPL license. Version 2.5.9 or higher available from: http://www.bioconductor.org/packages/devel/bioc/html/OncoSimulR.html. …”
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    OncoSimulR: genetic simulation with arbitrary epistasis and mutator genes in asexual populations
  5. 25
    “…Source code and documentation are available at http://github.com/dzarmola/knot_pull under GNU GPL license and include also a wrapper script for PyMOL for easier visualization. …”
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    Knot_pull—python package for biopolymer smoothing and knot detection
  6. 26
    “…ChARMView is freely available under the GNU GPL at .…”
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    Visualization-based discovery and analysis of genomic aberrations in microarray data
  7. 27
    “…The source code is available under the GNU GPL from .…”
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    BOWiki: an ontology-based wiki for annotation of data and integration of knowledge in biology
  8. 28
    “…“FA𝕊T” is available for free, under the GNU-GPL.…”
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    fMRI Artefact Rejection and Sleep Scoring Toolbox
  9. 29
    “…The OmicABEL software described in this manuscript is available under the GNU GPL v. 3 license as part of the GenABEL project for statistical genomics at http: //www.genabel.org/packages/OmicABEL.…”
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    High-Performance Mixed Models Based Genome-Wide Association Analysis with omicABEL software
  10. 30
    “…CoMeta is available at https://github.com/jkawulok/cometa under a free GNU GPL 2 license.…”
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    CoMeta: Classification of Metagenomes Using k-mers
  11. 31
    “…Availability and implementation: The code is available under GNU GPL at https://github.com/stamatak/ExaML. Contact: Alexandros.Stamatakis@h-its.org Supplementary information: Supplementary data are available at Bioinformatics online.…”
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    ExaML version 3: a tool for phylogenomic analyses on supercomputers
  12. 32
    “…The source code is distributed under the GNU GPL v3 license and can be obtained from the following GitHub repository: https://github.com/mad-lab/transit…”
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    TRANSIT - A Software Tool for Himar1 TnSeq Analysis
  13. 33
    “…SNP-sites is implemented in C and is available under the open source license GNU GPL version 3.…”
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    SNP-sites: rapid efficient extraction of SNPs from multi-FASTA alignments
  14. 34
    “…AVAILABILITY AND IMPLEMENTATION: Free software under the terms of the GNU GPL (https://github.com/lorrainea/CNEFinder).…”
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    CNEFinder: finding conserved non-coding elements in genomes
  15. 35
    “…AVAILABILITY AND IMPLEMENTATION: Pre-compiled executables, source code (open-source under GNU GPL) and a detailed manual are freely available from http://compbio.engr.uconn.edu/software/RANGER-DTL/. …”
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    RANGER-DTL 2.0: rigorous reconstruction of gene-family evolution by duplication, transfer and loss
  16. 36
    “…AVAILABILITY AND IMPLEMENTATION: The netboxr package is free and open-sourced under the GNU GPL-3 license R package available at https://www.bioconductor.org/packages/release/bioc/html/netboxr.html…”
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    netboxr: Automated discovery of biological process modules by network analysis in R
  17. 37
    “…AVAILABILITY AND IMPLEMENTATION: CONNECTOR is freely available under GNU GPL license at https://qbioturin.github.io/connector and https://doi.org/10.17504/protocols.io.8epv56e74g1b/v1.…”
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    CONNECTOR, fitting and clustering of longitudinal data to reveal a new risk stratification system
  18. 38
    “…All the design, construction and software files are freely available online under the GNU GPL v3 license at https://doi.org/10.17605/OSF.IO/K83X7. …”
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    ROMR: A ROS-based open-source mobile robot
  19. 39
    por Strimmer, Korbinian
    Publicado 2008
    “…The algorithm is implemented in R in the "fdrtool" package, available under the GNU GPL from and from the R package archive CRAN.…”
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    A unified approach to false discovery rate estimation
  20. 40
    “…Availability: A C++ implementation of the inference tool is available under GNU GPL license (http://www.sanger.ac.uk/resources/software/optimist/). …”
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    A method to infer positive selection from marker dynamics in an asexual population
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