-
161por Sauvage, Virginie, Boizeau, Laure, Candotti, Daniel, Vandenbogaert, Mathias, Servant-Delmas, Annabelle, Caro, Valérie, Laperche, Syria“…Despite this high error rate, the pairwise identity of MinION HBV consensus genome was consistent with Sanger sequencing method. …”
Publicado 2018
Enlace del recurso
Enlace del recurso
Enlace del recurso
Online Artículo Texto -
162por Phan, H T T, Stoesser, N, Maciuca, I E, Toma, F, Szekely, E, Flonta, M, Hubbard, A T M, Pankhurst, L, Do, T, Peto, T E A, Walker, A S, Crook, D W, Timofte, D“…A subset was sequenced with MinION to fully resolve NDM-1 plasmid structures. …”
Publicado 2018
Enlace del recurso
Enlace del recurso
Enlace del recurso
Online Artículo Texto -
163por Liao, Yu-Chieh, Cheng, Hung-Wei, Wu, Han-Chieh, Kuo, Shu-Chen, Lauderdale, Tsai-Ling Yang, Chen, Feng-Jui“…The Oxford Nanopore MinION is an affordable and portable DNA sequencer that can produce very long reads (tens of kilobase pairs), which enable de novo bacterial genome assembly. …”
Publicado 2019
Enlace del recurso
Enlace del recurso
Enlace del recurso
Online Artículo Texto -
164por Laamarti, Meriem, Chemao-Elfihri, M. W., Kartti, Souad, Laamarti, Rokia, Allam, Loubna, Ouadghiri, Mouna, Smyej, Imane, Rahoui, Jalila, Benrahma, Houda, Diawara, Idrissa, Alouane, Tarek, Essabbar, Abdelomunim, Siah, Samir, Karra, Mohammed, El Hafidi, Naima, El Jaoudi, Rachid, Sbabou, Laila, Nejjari, Chakib, Amzazi, Saaid, Mentag, Rachid, Belyamani, Lahcen, Ibrahimi, AzeddineEnlace del recurso
Publicado 2020
Enlace del recurso
Enlace del recurso
Online Artículo Texto -
165por Prussing, Catharine, Snavely, Emily A., Singh, Navjot, Lapierre, Pascal, Lasek-Nesselquist, Erica, Mitchell, Kara, Haas, Wolfgang, Owsiak, Rita, Nazarian, Elizabeth, Musser, Kimberlee A.Enlace del recurso
Publicado 2020
Enlace del recurso
Enlace del recurso
Online Artículo Texto -
166por Schwartz, Keike, Borowiak, Maria, Deneke, Carlus, Balau, Veronika, Metelmann, Claudia, Strauch, EckhardEnlace del recurso
Publicado 2021
Enlace del recurso
Enlace del recurso
Online Artículo Texto -
167por Bachtiar, Boy M., Theodorea, Citra F., Tahapary, Dicky L., Astrella, Cindy, -, Natalina, Bachtiar, Endang W.“…It is the first study in Indonesia to apply MinION-based, full-length 16S rRNA amplicon sequencing in periodontitis patients with and without diabetes.…”
Publicado 2021
Enlace del recurso
Enlace del recurso
Enlace del recurso
Online Artículo Texto -
168“…RESULTS: The genome of Ptr134 sequenced on a MinION using ONT was assembled into 28 contiguous sequences with a total length of 40.79 Mb and GC content of 50.81%. …”
Enlace del recurso
Enlace del recurso
Enlace del recurso
Online Artículo Texto -
169“…MinION is a fast, but highly error-prone sequencing device and it is a challenge to successfully identify the strain content of unknown simple or complex microbial samples. …”
Enlace del recurso
Enlace del recurso
Enlace del recurso
Online Artículo Texto -
170“…Both Oxford Nanopore Technologies (ONT) MinION and the Illumina (NGS) technology provide efficient methods to detect viral pathogens. …”
Enlace del recurso
Enlace del recurso
Enlace del recurso
Online Artículo Texto -
171por Marin, Clara, Marco-Jiménez, Francisco, Martínez-Priego, Llucia, De Marco-Romero, Griselda, Soriano-Chirona, Vicente, Lorenzo-Rebenaque, Laura, D’Auria, Giuseppe“…To improve this outcome, we have assembled a portable sequencing kit consisting of the Bento Lab and the MinION and developed a workflow for on-farm use that can detect and report the presence of Campylobacter in less than five hours from sampling to data. …”
Publicado 2022
Enlace del recurso
Enlace del recurso
Enlace del recurso
Online Artículo Texto -
172por Esnault, Gaelle, Earley, Bernadette, Cormican, Paul, Waters, Sinead M., Lemon, Ken, Cosby, S. Louise, Lagan, Paula, Barry, Thomas, Reddington, Kate, McCabe, Matthew S.“…Viral metagenomics sequencing on the portable, inexpensive Oxford Nanopore Technologies MinION sequencer and sequence analysis with its associated user-friendly point-and-click Epi2ME cloud-based pathogen identification software has the potential for point-of-care/same-day/sample-to-result metagenomic sequence diagnostics of known and unknown BRD pathogens to inform a rapid response and vaccine design. …”
Publicado 2022
Enlace del recurso
Enlace del recurso
Enlace del recurso
Online Artículo Texto -
173por Moon, Jangsup, Kim, Narae, Lee, Han Sang, Shin, Hye-Rim, Lee, Soon-Tae, Jung, Keun-Hwa, Park, Kyung-Il, Lee, Sang Kun, Chu, KonEnlace del recurso
Publicado 2017
Enlace del recurso
Enlace del recurso
Online Artículo Texto -
174
-
175“…Sequencing was performed on the MinION Flow cell MIN-106 R9.4. Nanopore raw FAST5 reads were base-called using Albacore v1.2.1, converted to FASTA and FASTQ formats using Poretools v0.6.0, and assembled using Unicycler v0.4.2, combining the long-read sequencing data with short-read data produced by Illumina sequencing. …”
Enlace del recurso
Enlace del recurso
Enlace del recurso
Online Artículo Texto -
176por Quan, Lili, Dong, Ruyi, Yang, Wenjuan, Chen, Lanyou, Lang, Jidong, Liu, Jia, Song, Yu, Ma, Shuiqing, Yang, Jialiang, Wang, Weiwei, Meng, Bo, Tian, GengEnlace del recurso
Publicado 2019
Enlace del recurso
Enlace del recurso
Online Artículo Texto -
177por Naushad, Sohail, Duceppe, Marc-Olivier, Dupras, Andrée Ann, Gao, Ruimin, Ogunremi, Dele“…Complete genome sequences of eight isolates of Salmonella enterica subsp. enterica from Canadian wild birds were determined by MinION and Illumina MiSeq sequencing. Assembled chromosomes had an average size of 4,833,662 bp. …”
Publicado 2020
Enlace del recurso
Enlace del recurso
Enlace del recurso
Online Artículo Texto -
178“…The virus genome was obtained using Oxford Nanopore MinION sequencing.…”
Enlace del recurso
Enlace del recurso
Enlace del recurso
Online Artículo Texto -
179por Schalamun, Miriam, Nagar, Ramawatar, Kainer, David, Beavan, Eleanor, Eccles, David, Rathjen, John P., Lanfear, Robert, Schwessinger, Benjamin“…One challenge of the MinION is that each group has to independently establish effective protocols for using the instrument, which can be time‐consuming and costly. …”
Publicado 2018
Enlace del recurso
Enlace del recurso
Enlace del recurso
Online Artículo Texto -
180por Kryukov, Alexey P., Spiridonova, Liudmila N., Tyunin, Alexey P., Kryukov, Kirill A., Dorda, Beatriz A.Enlace del recurso
Publicado 2020
Enlace del recurso
Online Artículo Texto