Materias dentro de su búsqueda.
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Contributions in ontology
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281“…Quantitative or numerical metrics of protein function specificity made possible by the Gene Ontology are useful in that they enable development of distance or similarity measures between protein functions. …”
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282por Wynden, Rob, Weiner, Mark G., Sim, Ida, Gabriel, Davera, Casale, Marco, Carini, Simona, Hastings, Shannon, Ervin, David, Tu, Samson, Gennari, John H., Anderson, Nick, Mobed, Ketty, Lakshminarayanan, Prakash, Massary, Maggie, Cucina, Russ J.“…In response to these shortcomings we have designed a Health Ontology Mapper (HOM) that translates terminologies into formal data encoding standards without altering the underlying source data. …”
Publicado 2010
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283“…Ontologies and standards are very important parts of today's bioscience research. …”
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284
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285por Tirmizi, Syed Hamid, Aitken, Stuart, Moreira, Dilvan A, Mungall, Chris, Sequeda, Juan, Shah, Nigam H, Miranker, Daniel P“…NCBO BioPortal currently hosts about 180 different biomedical ontologies. These ontologies have been mainly expressed in either the Open Biomedical Ontology (OBO) format or the Web Ontology Language (OWL). …”
Publicado 2011
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286por Hoehndorf, Robert, Dumontier, Michel, Gennari, John H, Wimalaratne, Sarala, de Bono, Bernard, Cook, Daniel L, Gkoutos, Georgios V“…CONCLUSIONS: We establish an information flow between biomedical ontologies and biosimulation models and we demonstrate that the integration of annotated biosimulation models and biomedical ontologies enables the verification of models as well as expressive queries. …”
Publicado 2011
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287por Bult, Carol J, Drabkin, Harold J, Evsikov, Alexei, Natale, Darren, Arighi, Cecilia, Roberts, Natalia, Ruttenberg, Alan, D'Eustachio, Peter, Smith, Barry, Blake, Judith A, Wu, Cathy“…The Protein Ontology (PRO) Consortium is filling this informatics resource gap by developing ontological representations and relationships among proteins and their variants and modified forms. …”
Publicado 2011
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288por Travillian, Ravensara S, Adamusiak, Tomasz, Burdett, Tony, Gruenberger, Michael, Hancock, John, Mallon, Ann-Marie, Malone, James, Schofield, Paul, Parkinson, Helen“…MOTIVATION: To evaluate how well current anatomical ontologies fit the way real-world users apply anatomy terms in their data annotations. …”
Publicado 2011
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289“…BACKGROUND: The Open Biomedical Ontologies (OBO) Foundry is a collection of freely available ontologically structured controlled vocabularies in the biomedical domain. …”
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290por Hayamizu, Terry F., de Coronado, Sherri, Fragoso, Gilberto, Sioutos, Nicholas, Kadin, James A., Ringwald, Martin“…Insights are presented into the overall process of comparing and mapping between ontologies, which may prove useful for further comparative analyses and ontology mapping efforts, especially those involving anatomy ontologies. …”
Publicado 2012
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291por Laulederkind, Stanley J. F., Tutaj, Marek, Shimoyama, Mary, Hayman, G. Thomas, Lowry, Timothy F., Nigam, Rajni, Petri, Victoria, Smith, Jennifer R., Wang, Shur-Jen, de Pons, Jeff, Dwinell, Melinda R., Jacob, Howard J.“…Database URL: http://rgd.mcw.edu/rgdweb/ontology/search.html…”
Publicado 2012
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292por Mungall, Christopher J, Torniai, Carlo, Gkoutos, Georgios V, Lewis, Suzanna E, Haendel, Melissa A“…The ontology represents structures in a species-neutral way and includes extensive associations to existing species-centric anatomical ontologies, allowing integration of model organism and human data. …”
Publicado 2012
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293por Shimoyama, Mary, Nigam, Rajni, McIntosh, Leslie Sanders, Nagarajan, Rakesh, Rice, Treva, Rao, D. C., Dwinell, Melinda R.“…Current practices allow researchers to access only those data involved in a single experiment or multiple experiments utilizing the same protocol. Results: Three ontologies were created: Clinical Measurement Ontology, Measurement Method Ontology and Experimental Condition Ontology. …”
Publicado 2012
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294“…Gene Ontology (GO) has established itself as the undisputed standard for protein function annotation. …”
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295“…The Open Biological and Biomedical Ontologies (OBO) Foundry consortium provides a repository of life-science ontologies, which are developed according to a set of shared principles. …”
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296“…With the availability of tools for automatic annotation of datasets with terms from disease ontologies, there is no reason to restrict enrichment analyses to the GO. …”
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297por Wu, Heng-Yi, Karnik, Shreyas, Subhadarshini, Abhinita, Wang, Zhiping, Philips, Santosh, Han, Xu, Chiang, Chienwei, Liu, Lei, Boustani, Malaz, Rocha, Luis M, Quinney, Sara K, Flockhart, David, Li, Lang“…CONCLUSIONS: The pharmacokinetics ontology annotates both in vitro pharmacokinetics experiments and in vivo pharmacokinetics studies. …”
Publicado 2013
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298“…We use a Bayesian network, structured according to the underlying ontology, to model the prior probability of a protein’s function. …”
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299por Batrancourt, Bénédicte MEnlace del recurso
Publicado 2013
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300por Dönitz, Jürgen, Grossmann, Daniela, Schild, Inga, Schmitt-Engel, Christian, Bradler, Sven, Prpic, Nikola-Michael, Bucher, Gregor“…In a morphological ontology the expert’s knowledge is represented in terms, which describe morphological structures and how these structures relate to each other. …”
Publicado 2013
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