Materias dentro de su búsqueda.
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Contributions in ontology
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481“…Although some resources exist, no suitably detailed and complex ontology exists nor any database allowing programmatic access. …”
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482“…Biomedical ontologies are heavily used to annotate data, and different ontologies are often interlinked by ontology mappings. …”
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483por Berges, Idoia, Antón, David, Bermúdez, Jesús, Goñi, Alfredo, Illarramendi, Arantza“…It integrates knowledge from ontological (e.g. FMA ontology) and non-ontological resources (e.g. a database of movements, exercises and treatment protocols) as well as additional physiotherapy-related knowledge. …”
Publicado 2016
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484“…BACKGROUND: Objectives of this work are to (1) present an ontological framework for the TNM classification system, (2) exemplify this framework by an ontology for colon and rectum tumours, and (3) evaluate this ontology by assigning TNM classes to real world pathology data. …”
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485por Bible, Paul W., Sun, Hong-Wei, Morasso, Maria I., Loganantharaj, Rasiah, Wei, Lai“…The structured vocabulary that describes gene function, the gene ontology (GO), serves as a powerful tool in biological research. …”
Publicado 2017
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486“…Understanding ontology structures and overlapping ontologies is essential for tasks such as ontology reuse and development. …”
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487“…We describe how we use ontologies in the IEDB, providing a concrete example of the benefits of ontologies in practice. …”
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488por Uciteli, Alexandr, Neumann, Juliane, Tahar, Kais, Saleh, Kutaiba, Stucke, Stephan, Faulbrück-Röhr, Sebastian, Kaeding, André, Specht, Martin, Schmidt, Tobias, Neumuth, Thomas, Besting, Andreas, Stegemann, Dominik, Portheine, Frank, Herre, Heinrich“…For the identification of the ontologically specified risks, we developed an ontology-based software module, called Ontology-based Risk Detector (OntoRiDe). …”
Publicado 2017
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489por Ali, Najib M., Khan, Haris A., Then, Amy Y-Hui, Ving Ching, Chong, Gaur, Manas, Dhillon, Sarinder Kaur“…Life science ontologies play an important role in Semantic Web. Given the diversity in fish species and the associated wealth of information, it is imperative to develop an ontology capable of linking and integrating this information in an automated fashion. …”
Publicado 2017
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490“…BACKGROUND: Ontologies are representations of a conceptualization of a domain. …”
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491por Osumi-Sutherland, David“…Structured annotation with ontology terms provides a potential solution to these problems. …”
Publicado 2017
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492“…The Gene Ontology (GO) (Ashburner et al., Nat Genet 25(1):25–29, 2000) is a powerful tool in the informatics arsenal of methods for evaluating annotations in a protein dataset. …”
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493por Lundh, Lars-Gunnar“…The present paper outlines the nature of a three-dimensional ontology and the place of psychological science within this ontology, in a way that is partly similar to and partly different from that of Pérez-Álvarez. …”
Publicado 2017
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494“…Our results showed several coherent clustered ontologies where many taxa could influence brain expression and physiology. …”
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495“…BACKGROUND: The goal of ontology matching is to identify correspondences between entities from different yet overlapping ontologies so as to facilitate semantic integration, reuse and interoperability. …”
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496“…In addition, we use ontologies to automatically generate features that serve as the input for the supervised learning algorithms that produce the classification model. …”
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497por Klopfenstein, D. V., Zhang, Liangsheng, Pedersen, Brent S., Ramírez, Fidel, Warwick Vesztrocy, Alex, Naldi, Aurélien, Mungall, Christopher J., Yunes, Jeffrey M., Botvinnik, Olga, Weigel, Mark, Dampier, Will, Dessimoz, Christophe, Flick, Patrick, Tang, Haibao“…The biological interpretation of gene lists with interesting shared properties, such as up- or down-regulation in a particular experiment, is typically accomplished using gene ontology enrichment analysis tools. Given a list of genes, a gene ontology (GO) enrichment analysis may return hundreds of statistically significant GO results in a “flat” list, which can be challenging to summarize. …”
Publicado 2018
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498“…BACKGROUND: While representation learning techniques have shown great promise in application to a number of different NLP tasks, they have had little impact on the problem of ontology matching. Unlike past work that has focused on feature engineering, we present a novel representation learning approach that is tailored to the ontology matching task. …”
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499“…To implement the cooperation between intelligent applications based on biomedical ontologies, it is crucial to establish correspondences between the heterogeneous biomedical concepts in different ontologies, which is so-called biomedical ontology matching. …”
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500“…A common approach consists of reviewing Gene Ontology (GO) annotations for entries in such lists and searching for enrichment patterns. …”
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