Materias dentro de su búsqueda.
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Contributions in ontology
1
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601por Bard, Jonathan B. L.“…This paper describes the AEO, an ontology of anatomical entities that expands the common anatomy reference ontology (CARO) and whose major novel feature is a type hierarchy of ~160 anatomical terms. …”
Publicado 2012
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602“…METHODS: We have developed novel semantic similarity method, which use Gene Ontology (GO) annotations to measure the reliability of protein-protein interactions. …”
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603por Mattingly, Carolyn J., McKone, Thomas E., Callahan, Michael A., Blake, Judith A., Hubal, Elaine A. Cohen“…Major concepts were defined and the ontology drafted and evaluated by a working group of exposure scientists and other ontology and database experts. …”
Publicado 2012
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604“…Motivation: Ontologies are an everyday tool in biomedicine to capture and represent knowledge. …”
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605
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606por Sykacek, P.“…A common approach for representing high level information is by inferring gene ontology (GO) terms which may be attributed to the expression data experiment. …”
Publicado 2012
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607“…Here, we present the Units Ontology (UO), an ontology currently being used in many scientific resources for the standardized description of units of measurements.…”
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608por Jupp, Simon, Horridge, Matthew, Iannone, Luigi, Klein, Julie, Owen, Stuart, Schanstra, Joost, Wolstencroft, Katy, Stevens, Robert“…As more ontology based applications begin to emerge, tools are required that enable domain experts to contribute their knowledge to the growing pool of ontologies. …”
Publicado 2012
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609“…The objective of this study is to develop a novel approach that integrates prior biological knowledge in the form of the Ontology Fingerprint to infer cell-type-specific signaling networks via data-driven Bayesian network learning; and to further use the trained model to predict cellular responses. …”
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610por Mutowo-Meullenet, Prudence, Huntley, Rachael P., Dimmer, Emily C., Alam-Faruque, Yasmin, Sawford, Tony, Jesus Martin, Maria, O’Donovan, Claire, Apweiler, Rolf“…The Gene Ontology (GO) is the de facto standard for the functional description of gene products, providing a consistent, information-rich terminology applicable across species and information repositories. …”
Publicado 2013
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611por Vita, Randi, Overton, James A, Greenbaum, Jason A, Sette, Alessandro, Peters, Bjoern“…Ontologies categorize entities, express relationships between them, and provide standardized definitions. …”
Publicado 2013
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613por Hayamizu, Terry F, Wicks, Michael N, Davidson, Duncan R, Burger, Albert, Ringwald, Martin, Baldock, Richard A“…BACKGROUND: The Edinburgh Mouse Atlas Project (EMAP) ontology of mouse developmental anatomy provides a standard nomenclature for describing normal and mutant mouse embryo anatomy. …”
Publicado 2013
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614por Gao, Yu-Fei, Chen, Lei, Huang, Guo-Hua, Zhang, Tao, Feng, Kai-Yan, Li, Hai-Peng, Jiang, Yang“…The good performance of the method indicates that the ontology information of the drugs contains rich information about their target groups, and the study may become an inspiration to solve the problems of this sort and bridge the gap between ChEBI ontology and drugs target groups.…”
Publicado 2013
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615por Francis, Richard W.“…The Gene Ontology (GO) provides a resource for consistent annotation of genes and gene products that is extensively used by numerous large public repositories. …”
Publicado 2013
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616“…To understand their functions, the sets are usually mapped to Gene Ontology knowledge bases by means of over-representation analysis (ORA). …”
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617por Natale, Darren A., Arighi, Cecilia N., Blake, Judith A., Bult, Carol J., Christie, Karen R., Cowart, Julie, D’Eustachio, Peter, Diehl, Alexander D., Drabkin, Harold J., Helfer, Olivia, Huang, Hongzhan, Masci, Anna Maria, Ren, Jia, Roberts, Natalia V., Ross, Karen, Ruttenberg, Alan, Shamovsky, Veronica, Smith, Barry, Yerramalla, Meher Shruti, Zhang, Jian, AlJanahi, Aisha, Çelen, Irem, Gan, Cynthia, Lv, Mengxi, Schuster-Lezell, Emily, Wu, Cathy H.“…The Protein Ontology (PRO; http://proconsortium.org) formally defines protein entities and explicitly represents their major forms and interrelations. …”
Publicado 2014
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618“…Constructing ontology manually is a time-consuming, error-prone, and tedious task. …”
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619por Hoehndorf, Robert, Haendel, Melissa, Stevens, Robert, Rebholz-Schuhmann, Dietrich“…Here, we introduce the JBMS thematic series on Biomedical Ontologies. The aim of the series is to disseminate the latest developments in research on biomedical ontologies and provide a venue for publishing newly developed ontologies, updates to existing ontologies as well as methodological advances, and selected contributions from conferences and workshops. …”
Publicado 2014
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620por Manni, Lucia, Gasparini, Fabio, Hotta, Kohji, Ishizuka, Katherine J., Ricci, Lorenzo, Tiozzo, Stefano, Voskoboynik, Ayelet, Dauga, Delphine“…Ontologies provide an important resource to integrate information. …”
Publicado 2014
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