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  1. 601
    por Bard, Jonathan B. L.
    Publicado 2012
    “…This paper describes the AEO, an ontology of anatomical entities that expands the common anatomy reference ontology (CARO) and whose major novel feature is a type hierarchy of ~160 anatomical terms. …”
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  2. 602
    por Xu, Bo, Lin, Hongfei, Yang, Zhihao
    Publicado 2011
    “…METHODS: We have developed novel semantic similarity method, which use Gene Ontology (GO) annotations to measure the reliability of protein-protein interactions. …”
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  3. 603
    “…Major concepts were defined and the ontology drafted and evaluated by a working group of exposure scientists and other ontology and database experts. …”
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  4. 604
    “…Motivation: Ontologies are an everyday tool in biomedicine to capture and represent knowledge. …”
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  5. 605
  6. 606
    por Sykacek, P.
    Publicado 2012
    “…A common approach for representing high level information is by inferring gene ontology (GO) terms which may be attributed to the expression data experiment. …”
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  7. 607
    “…Here, we present the Units Ontology (UO), an ontology currently being used in many scientific resources for the standardized description of units of measurements.…”
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  8. 608
    “…As more ontology based applications begin to emerge, tools are required that enable domain experts to contribute their knowledge to the growing pool of ontologies. …”
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  9. 609
    “…The objective of this study is to develop a novel approach that integrates prior biological knowledge in the form of the Ontology Fingerprint to infer cell-type-specific signaling networks via data-driven Bayesian network learning; and to further use the trained model to predict cellular responses. …”
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  10. 610
    “…The Gene Ontology (GO) is the de facto standard for the functional description of gene products, providing a consistent, information-rich terminology applicable across species and information repositories. …”
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  11. 611
    “…Ontologies categorize entities, express relationships between them, and provide standardized definitions. …”
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  12. 612
  13. 613
    “…BACKGROUND: The Edinburgh Mouse Atlas Project (EMAP) ontology of mouse developmental anatomy provides a standard nomenclature for describing normal and mutant mouse embryo anatomy. …”
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  14. 614
    “…The good performance of the method indicates that the ontology information of the drugs contains rich information about their target groups, and the study may become an inspiration to solve the problems of this sort and bridge the gap between ChEBI ontology and drugs target groups.…”
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  15. 615
    por Francis, Richard W.
    Publicado 2013
    “…The Gene Ontology (GO) provides a resource for consistent annotation of genes and gene products that is extensively used by numerous large public repositories. …”
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  16. 616
    por Ultsch, Alfred, Lötsch, Jörn
    Publicado 2014
    “…To understand their functions, the sets are usually mapped to Gene Ontology knowledge bases by means of over-representation analysis (ORA). …”
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  17. 617
  18. 618
    por Hu, Fanghuai, Shao, Zhiqing, Ruan, Tong
    Publicado 2014
    “…Constructing ontology manually is a time-consuming, error-prone, and tedious task. …”
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  19. 619
    “…Here, we introduce the JBMS thematic series on Biomedical Ontologies. The aim of the series is to disseminate the latest developments in research on biomedical ontologies and provide a venue for publishing newly developed ontologies, updates to existing ontologies as well as methodological advances, and selected contributions from conferences and workshops. …”
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  20. 620
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