Materias dentro de su búsqueda.
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Contributions in ontology
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781por Birmingham, Amanda, Clemente, Jose C., Desai, Narayan, Gilbert, Jack, Gonzalez, Antonio, Kyrpides, Nikos, Meyer, Folker, Nawrocki, Eric, Sterk, Peter, Stombaugh, Jesse, Weinberg, Zasha, Wendel, Doug, Leontis, Neocles B., Zirbel, Craig, Knight, Rob, Laederach, Alain“…This report summarizes the proceedings of the structure mapping working group meeting of the RNA Ontology Consortium (ROC), held in Kona, Hawaii on January 8-9, 2011. …”
Publicado 2011
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782Ontology patterns for tabular representations of biomedical knowledge on neglected tropical diseases“…Motivation: Ontology-like domain knowledge is frequently published in a tabular format embedded in scientific publications. …”
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783“…ARISTO provides assignments to a subset of the ChEBI (Chemical Entities of Biological Interest) dictionary, an ontology, which aims to cover biologically relevant small molecules. …”
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784por Li, Jiang, Gong, Binsheng, Chen, Xi, Liu, Tao, Wu, Chao, Zhang, Fan, Li, Chunquan, Li, Xiang, Rao, Shaoqi, Li, Xia“…BACKGROUND: The construction of the Disease Ontology (DO) has helped promote the investigation of diseases and disease risk factors. …”
Publicado 2011
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785“…As these tools increase in prevalence, the need for improved standardization in processing and presentation of data increases, as does the need to guard against interpretation bias. Gene Ontology (GO) analysis is a powerful method of interpreting and summarizing biological functions. …”
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786“…The goal of the Gene Ontology (GO) project is to provide a uniform way to describe the functions of gene products from organisms across all kingdoms of life and thereby enable analysis of genomic data. …”
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787“…With high-throughput technologies providing vast amounts of data, it has become more important to provide systematic, quality annotations. The Gene Ontology (GO) project is the largest resource for cataloguing gene function. …”
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788por Yamamoto, Satoko, Sakai, Noriko, Nakamura, Hiromi, Fukagawa, Hiroshi, Fukuda, Ken, Takagi, Toshihisa“…We use a hierarchical pathway representation model with a compound graph, and every pathway component in the INOH database is annotated by a set of uniquely developed ontologies. Finally, we developed the Similarity Search using the combination of a compound graph and hierarchical ontologies. …”
Publicado 2011
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789“…Even though the problem-solving approach was instantiated with profiling sensor systems and algorithms, the ontological framework may be useful with other heterogeneous sensing-system environments.…”
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790“…Navigation and analysis of ontology data can be performed using the ontology browser available at: http://vulcan.cs.uga.edu/prokino.…”
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791por Niknejad, Anne, Comte, Aurélie, Parmentier, Gilles, Roux, Julien, Bastian, Frederic B., Robinson-Rechavi, Marc“…Motivation: Most anatomical ontologies are species-specific, whereas a framework for comparative studies is needed. …”
Publicado 2012
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792por Duan, Lian, Hastings, Janna, de Matos, Paula, Ennis, Marcus, Steinbeck, ChristophEnlace del recurso
Publicado 2012
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793“…The wide coverage and biological relevance of the Gene Ontology (GO), confirmed through its successful use in protein function prediction, have led to the growth in its popularity. …”
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794por Zambon, Alexander C., Gaj, Stan, Ho, Isaac, Hanspers, Kristina, Vranizan, Karen, Evelo, Chris T., Conklin, Bruce R., Pico, Alexander R., Salomonis, Nathan“…Summary: We introduce GO-Elite, a flexible and powerful pathway analysis tool for a wide array of species, identifiers (IDs), pathways, ontologies and gene sets. In addition to the Gene Ontology (GO), GO-Elite allows the user to perform over-representation analysis on any structured ontology annotations, pathway database or biological IDs (e.g. gene, protein or metabolite). …”
Publicado 2012
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795por Sy, Mohameth-François, Ranwez, Sylvie, Montmain, Jacky, Regnault, Armelle, Crampes, Michel, Ranwez, Vincent“…Some improvements have been offered by semantic Web technologies and applications based on domain ontologies. In life science, for instance, the Gene Ontology is widely exploited in genomic applications and the Medical Subject Headings is the basis of biomedical publications indexation and information retrieval process proposed by PubMed. …”
Publicado 2012
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796por Oellrich, Anika, Gkoutos, Georgios V, Hoehndorf, Robert, Rebholz-Schuhmann, Dietrich“…Here, we investigate the quality and completeness of two different methods to align the Human Phenotype Ontology and the Mammalian Phenotype Ontology. The first method combines lexical matching with inference over the ontologies' taxonomic structures, while the second method uses a mapping algorithm based on the formal definitions of the ontologies. …”
Publicado 2012
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797“…Ontologies are widely used in the biomedical community for annotation and integration of databases. …”
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798“…MGI is one of the founding members of the Gene Ontology (GO) and uses the GO for functional annotation of genes. …”
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799por Maguire, Eamonn, González-Beltrán, Alejandra, Whetzel, Patricia L., Sansone, Susanna-Assunta, Rocca-Serra, Philippe“…Results: OntoMaton is an open source solution that brings ontology lookup and tagging capabilities into a cloud-based collaborative editing environment, harnessing Google Spreadsheets and the NCBO Web services. …”
Publicado 2013
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800“…GOGANPA’s sole reliance on gene ontology further allows GOGANPA to be widely applicable to the analysis of any gene-ontology-annotated genome.…”
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