Materias dentro de su búsqueda.
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Contributions in ontology
1
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1021“…As a consequence, ontology repositories, as well as most other tools utilizing ontologies, either provide access to ontologies without use of automated reasoning, or limit the number of ontologies for which automated reasoning-based access is provided. …”
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1022“…Here we present FFPred 3, which is intended for assigning Gene Ontology terms to human protein chains, when homology with characterized proteins can provide little aid. …”
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1023por Buttigieg, Pier Luigi, Pafilis, Evangelos, Lewis, Suzanna E., Schildhauer, Mark P., Walls, Ramona L., Mungall, Christopher J.“…We have also taken steps to better align ENVO with the Open Biological and Biomedical Ontologies (OBO) Foundry principles and interoperate with existing OBO ontologies. …”
Publicado 2016
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1024por Chalk, Stuart J.“…This paper describes a fundamental data model for scientific data that can be applied to data currently stored in any format, and an associated ontology that affords semantic representation of the structure of scientific data (and its metadata), upon which discipline specific semantics can be applied. …”
Publicado 2016
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1025“…In this study, we tried to extract important gene ontology (GO) terms and KEGG pathways for pancreatic cancer by adopting some existing computational methods. …”
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1026por Vinayagam, Arunachalam, König, Rainer, Moormann, Jutta, Schubert, Falk, Eils, Roland, Glatting, Karl-Heinz, Suhai, Sándor“…In our approach, annotation was provided through Gene Ontology terms by applying multiple Support Vector Machines (SVM) for the classification of correct and false predictions. …”
Publicado 2004
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1027por Gao, Wei, Qudair Baig, Abdul, Ali, Haidar, Sajjad, Wasim, Reza Farahani, Mohammad“…In biology field, the ontology application relates to a large amount of genetic information and chemical information of molecular structure, which makes knowledge of ontology concepts convey much information. …”
Publicado 2017
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1028por Hulo, Chantal, Masson, Patrick, de Castro, Edouard, Auchincloss, Andrea H., Foulger, Rebecca, Poux, Sylvain, Lomax, Jane, Bougueleret, Lydie, Xenarios, Ioannis, Le Mercier, Philippe“…To demonstrate the utility of a standard ontology for virus biology, this work was completed by annotating virus data in the ViralZone, UniProtKB and Gene Ontology databases.…”
Publicado 2017
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1029por Chen, Xinrang“…In the current study, we planned to predict the optimal gene functions for osteosarcoma (OS) by integrating network-based method with guilt by association (GBA) principle (called as network-based gene function inference approach) based on gene ontology (GO) data and gene expression profile. To begin with, differentially expressed genes (DEGs) were extracted using linear models for microarray data (LIMMA) package. …”
Publicado 2017
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1030“…SUMMARY: The lack of controlled terminology and ontology usage leads to incomplete search results and poor interoperability between databases. …”
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1031“…We compared tools based on Unified Medical Language System with tools that use topic-specific ontologies, showing that the second approach outperforms the first both in the annotation process and in the computation of semantic similarity measures. …”
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1032“…The MP Ontology supports different levels and richness of phenotypic knowledge and flexible annotations to individual genotypes. …”
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1033por Alirezaie, Marjan, Renoux, Jennifer, Köckemann, Uwe, Kristoffersson, Annica, Karlsson, Lars, Blomqvist, Eva, Tsiftes, Nicolas, Voigt, Thiemo, Loutfi, Amy“…We focus on integrating measurements gathered from heterogeneous sources by using ontologies in order to enable semantic interpretation of events and context awareness. …”
Publicado 2017
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1034por Chan, Lawrence W. C., Wong, S. C. Cesar, Chiau, Choo Chiap, Chan, Tak-Ming, Tao, Liang, Feng, Jinghan, Chiu, Keith W. H.“…We extracted terms related to liver cancer from the reports and mapped them to ontological features using Systematized Nomenclature of Medicine (SNOMED) Clinical Terms (CT). …”
Publicado 2017
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1035por Personeni, Gabin, Bresso, Emmanuel, Devignes, Marie-Dominique, Dumontier, Michel, Smaïl-Tabbone, Malika, Coulet, Adrien“…The proposed representation is flexible and can be extended to make use of additional ontologies and various patient records.…”
Publicado 2017
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1036por Chen, Lei, Zhang, Yu-Hang, Wang, ShaoPeng, Zhang, YunHua, Huang, Tao, Cai, Yu-Dong“…In this study, we investigated the essential and non-essential genes reported in a previous study and extracted gene ontology (GO) terms and biological pathways that are important for the determination of essential genes. …”
Publicado 2017
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1037“…BACKGROUND: Gene Ontology (GO) is the largest resource for cataloging gene products. …”
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1038
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1039“…The achievement of efficient, effective and timely synthesis of evidence is facilitated by using ‘ontologies’ to systematically structure and organise the evidence about constructs and their relationships, using a controlled, well-defined vocabulary.…”
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1040por Ong, Edison, Xie, Jiangan, Ni, Zhaohui, Liu, Qingping, Sarntivijai, Sirarat, Lin, Yu, Cooper, Daniel, Terryn, Raymond, Stathias, Vasileios, Chung, Caty, Schürer, Stephan, He, Yongqun“…The community-based Cell Line Ontology (CLO) is selected as the default ontology for LINCS cell line representation and integration. …”
Publicado 2017
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