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801por Ridlon, Jason M., Ikegawa, Shigeo, Alves, João M. P., Zhou, Biao, Kobayashi, Akiko, Iida, Takashi, Mitamura, Kuniko, Tanabe, Genzoh, Serrano, Myrna, De Guzman, Ainee, Cooper, Patsy, Buck, Gregory A., Hylemon, Phillip B.“…Using RNA-Seq technology, we identified a cortisol-inducible (∼1,000-fold) operon (desABCD) encoding at least one enzyme involved in anaerobic side-chain cleavage. …”
Publicado 2013
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802por Romsang, Adisak, Duang-Nkern, Jintana, Leesukon, Panithi, Saninjuk, Kritsakorn, Vattanaviboon, Paiboon, Mongkolsuk, Skorn“…The IscR-mediated regulation of the Pseudomonas aeruginosa isc operon, which is involved in iron-sulphur cluster ([Fe-S]) biogenesis, was analysed. …”
Publicado 2014
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803“…Expression of the mer operon is under tight control by the dual-function transcriptional regulator MerR. …”
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804por Kawai, Mikihiko, Higashiura, Norie, Hayasaki, Kimie, Okamoto, Naruhei, Takami, Akiko, Hirakawa, Hideki, Matsushita, Kazunobu, Azuma, Yoshinao“…The cyoABCD-1 operon was phylogenetically common to AAB genomes, whereas the cyoABCD-2 operon belonged to a lineage distinctive from the cyoABCD-1 operon. …”
Publicado 2015
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805“…Certain experimental evidences suggest that gamma-proteobacterial Acidothiobacillus thiooxidans; lacking the sulphur-oxidizing (sox) operon, has an alternative thiosulphate oxidation pathway. …”
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806por Jõesaar, Merike, Viggor, Signe, Heinaru, Eeva, Naanuri, Eve, Mehike, Maris, Leito, Ivo, Heinaru, Ain“…It harbours two chromosomally located catechol meta pathways, one of which is structurally and phylogenetically very similar to the Pseudomonas sp. CF600 dmp operon and the other to the P. stutzeri AN10 nah lower operon. …”
Publicado 2017
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807“…Apart from the mecD operon, that shared 66% overall nucleotide identity with the mecB operon, McRI(mecD) islands were unrelated to any mecB-carrying elements or staphylococcal cassette chromosome mec. …”
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808por Ares, Miguel A., Fernández-Vázquez, José L., Pacheco, Sabino, Martínez-Santos, Verónica I., Jarillo-Quijada, Ma. Dolores, Torres, Javier, Alcántar-Curiel, María D., González-y-Merchand, Jorge A., De la Cruz, Miguel A.“…T3P is genetically organized in three transcriptional units: the mrkABCDF polycistronic operon, the mrkHI bicistronic operon and the mrkJ gene. …”
Publicado 2017
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809por Lhospice, Sébastien, Gomez, Nicolas Oswaldo, Ouerdane, Laurent, Brutesco, Catherine, Ghssein, Ghassan, Hajjar, Christine, Liratni, Ahmed, Wang, Shuanglong, Richaud, Pierre, Bleves, Sophie, Ball, Geneviève, Borezée-Durant, Elise, Lobinski, Ryszard, Pignol, David, Arnoux, Pascal, Voulhoux, Romé“…In vivo, the pseudopaline operon is regulated by zinc through the Zur repressor. …”
Publicado 2017
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810“…PCC 6803 relies on expression of the putative pilA9-pilA10-pilA11-slr2018 operon. In this study, we identified the antisense RNA PilR encoded in the noncoding strand of the prepilin-encoding gene pilA11. …”
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811por Bachmann, Nathan L., Salamzade, Rauf, Manson, Abigail L., Whittington, Richard, Sintchenko, Vitali, Earl, Ashlee M., Marais, Ben J.“…We compared the genomes of 157 mycobacterial species, representing all major branches of the mycobacterial phylogenetic tree to identify genes and operons enriched among rapid and slow growing mycobacteria. …”
Publicado 2020
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812por Han, Sen, Shen, Danyu, Wang, Yu‐Chuan, Chou, Shan‐Ho, Gomelsky, Mark, Gao, Yong‐Gui, Qian, Guoliang“…We show that the YajQ homologue, CdgL (c‐di‐GMP receptor interacting with LysR) affects expression of the HSAF biosynthesis operon by interacting with the transcription activator LysR. …”
Publicado 2019
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813“…Genes for its synthesis and export are encoded by the 12 kb ptx-ptl operon, which is under the control of the pertussis promoter, Pptx. …”
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814por Cenens, William, Andrade, Maxuel O., Llontop, Edgar, Alvarez-Martinez, Cristina E., Sgro, Germán G., Farah, Chuck S.“…Here we show that the chromosomal virB operon, which encodes the structural genes of this T4SS in X. citri, is regulated by the conserved global regulator CsrA. …”
Publicado 2020
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815“…Of these populations, 21 had a mutation in the hslVU or rpoBC operon, suggesting that mutations in either operon could drive rescue. …”
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816por Hall, James P. J., Wright, Rosanna C. T., Harrison, Ellie, Muddiman, Katie J., Wood, A. Jamie, Paterson, Steve, Brockhurst, Michael A.“…By combining the results of experimental evolution with genetics and transcriptomics, we show here that fitness costs of 2 divergent large plasmids in Pseudomonas fluorescens are caused by inducing maladaptive expression of a chromosomal tailocin toxin operon. Mutations in single genes unrelated to the toxin operon, and located on either the chromosome or the plasmid, ameliorated the disruption associated with plasmid carriage. …”
Publicado 2021
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817por Mateus, André, Shah, Malay, Hevler, Johannes, Kurzawa, Nils, Bobonis, Jacob, Typas, Athanasios, Savitski, Mikhail M.“…Single-gene deletions can affect the expression levels of other genes in the same operon in bacterial genomes. Here, we used proteomics for 133 Escherichia coli gene deletion mutants and transcriptome sequencing (RNA-seq) data from 71 mutants to probe the extent of transcriptional and post-transcriptional effects of gene deletions in operons. …”
Publicado 2021
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818“…Bioinformatics analysis allowed the identification of the BT1522–1526 operon putatively involved in IPC synthesis. Mutagenesis studies revealed that BT1522–1526 is essential for the synthesis of phosphatidylinositol (PI) and IPC, confirming the role of this operon in the biosynthesis of IPC. …”
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819por Hooppaw, Anna J., McGuffey, Jenna C., Di Venanzio, Gisela, Ortiz-Marquez, Juan C., Weber, Brent S., Lightly, Tasia Joy, van Opijnen, Tim, Scott, Nichollas E., Cardona, Silvia T., Feldman, Mario F.“…We conclude that the paa operon is part of a regulatory network that responds to antibiotic and oxidative stress and is important for virulence. …”
Publicado 2022
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820por Fernández-Vázquez, Jorge, Cabrer-Panes, Juan David, Åberg, Anna, Juárez, Antonio, Madrid, Cristina, Gaviria-Cantin, Tania, Fernández-Coll, Llorenç, Vargas-Sinisterra, Andrés Felipe, Jiménez, Carlos Jonay, Balsalobre, Carlos“…Prototrophy suppressor mutations in a ppGpp-deficient strain restore the α-hemolysin expression from this operon to wild-type levels, confirming the requirement of ppGpp for its expression. ppGpp stimulates hlyCABD(II) expression independently of RpoS, RfaH, Zur, and H-NS. …”
Publicado 2022
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