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281“…Our results show that, first, the Tte riboswitch is more thermotolerant than the Bsu riboswitch, despite only subtle sequence differences. …”
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282“…Riboswitches are genetic control elements within non-coding regions of mRNA. …”
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283“…Long-range tertiary interactions determine the three-dimensional structure of a number of metabolite-binding riboswitch RNA elements and were found to be important for their regulatory function. …”
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284“…[Image: see text] Riboswitches regulate gene expression via specific recognition of cognate metabolites by their aptamer domains, which fold into stable conformations upon ligand binding. …”
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285por Buck, Janina, Wacker, Anna, Warkentin, Eberhart, Wöhnert, Jens, Wirmer-Bartoschek, Julia, Schwalbe, Harald“…Riboswitch RNAs fold into complex tertiary structures upon binding to their cognate ligand. …”
Publicado 2011
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286por Eichhorn, Catherine D., Feng, Jun, Suddala, Krishna C., Walter, Nils G., Brooks, Charles L., Al-Hashimi, Hashim M.“…Here, we report the collaborative application of nuclear magnetic resonance (NMR) and replica exchange molecular dynamics (REMD) simulations to characterize the 12 nt ssRNA tail derived from the prequeuosine riboswitch. NMR carbon spin relaxation data and residual dipolar coupling measurements reveal a flexible yet stacked core adopting an A-form-like conformation, with the level of order decreasing toward the terminal ends. …”
Publicado 2012
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287“…PreQ(1) riboswitches regulate genes by binding the pyrrolopyrimidine intermediate preQ(1) during biosynthesis of the essential tRNA base queuosine. …”
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288por Demolli, Shemsi, Geist, Miriam M., Weigand, Julia E., Matschiavelli, Nicole, Suess, Beatrix, Rother, Michael“…Furthermore, a series of fusions comprised of a constitutive promoter and sequences encoding variants of the synthetic tetracycline-responsive riboswitch (tc-RS) was created to characterize its influence on translation initiation in M. acetivorans. …”
Publicado 2014
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289por Drory Retwitzer, Matan, Kifer, Ilona, Sengupta, Supratim, Yakhini, Zohar, Barash, Danny“…Riboswitches are RNA genetic control elements that were originally discovered in bacteria and provide a unique mechanism of gene regulation. …”
Publicado 2015
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290“…Riboswitches are mRNA elements regulating gene expression in response to direct binding of a metabolite. …”
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291“…Metabolite-responsive RNA pseudoknots derived from prokaryotic riboswitches have been shown to stimulate −1 programmed ribosomal frameshifting (PRF), suggesting −1 PRF as a promising gene expression platform to extend riboswitch applications in higher eukaryotes. …”
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292“…Sequence and secondary structure comparisons indicated that the streptococcal riboswitch belongs to the class of tandem aptamer glycine riboswitches.…”
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293“…Riboswitches contain structured aptamer domains that, upon ligand binding, facilitate helical switching in their downstream expression platforms to alter gene expression. …”
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294por Chi, Xintong, Zhang, Shanshan, Sun, Huili, Duan, Yangkai, Qiao, Cuncun, Luan, Guodong, Lu, Xuefeng“…In this work, we adopted a theophylline-responsive riboswitch to engineer and control glgC expression in Synechococcus elongatus PCC7942 and achieved flexible regulation of intracellular GlgC abundance and glycogen storage. …”
Publicado 2019
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295por Connelly, Colleen M., Numata, Tomoyuki, Boer, Robert E., Moon, Michelle H., Sinniah, Ranu S., Barchi, Joseph J., Ferré-D’Amaré, Adrian R., Schneekloth, John S.“…Riboswitches are naturally occurring RNA aptamers that regulate gene expression by binding to specific small molecules. …”
Publicado 2019
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296por Martin, Julia E, Le, My T, Bhattarai, Nabin, Capdevila, Daiana A, Shen, Jiangchuan, Winkler, Malcolm E, Giedroc, David P“…In other bacteria, Mn homeostasis is controlled by yybP-ykoY family riboswitches. Here, we characterize a yybP-ykoY family riboswitch upstream of the mgtA gene encoding a P(II)-type ATPase in S. pneumoniae, suggested previously to function in Ca(2+) efflux. …”
Publicado 2019
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297“…The widespread ykkC-I riboswitch class exemplifies divergent riboswitch evolution. …”
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298“…Here, we compared a small library of promoter–riboswitch constructs for synthetic biology applications in Anabaena sp. …”
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299“…Riboswitches are naturally occurring RNA elements that control bacterial gene expression by binding to specific small molecules. …”
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300por Zhang, Minmin, Liu, Guangfeng, Zhang, Yunlong, Chen, Ting, Feng, Shanshan, Cai, Rujie, Lu, Changrui“…Riboswitches are regulatory noncoding RNAs found in bacteria, fungi and plants, that modulate gene expressions through structural changes in response to ligand binding. …”
Publicado 2022
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