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  1. 2281
    “…The framework presented in this paper can also be applied to develop new tools for compressing other sequencing data. The open-source code of repaq is available at: https://github.com/OpenGene/repaq.…”
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  2. 2282
    “…Moreover, WGAs support lift-over and help confirm gene presence-absence variation. Source code and documentation: https://github.com/Ensembl/plant-scripts. …”
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  3. 2283
    “…AVAILABILITY: The daggle app can be accessed online at [http://cbdrh.shinyapps.io/daggle]. The source code is available on GitHub [https://github.com/CBDRH/daggle] and is released under a Creative Commons CC BY-NC-SA 4.0 licence.…”
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  4. 2284
    “…AVAILABILITY AND IMPLEMENTATION: The source code of CSNN and datasets used in the experiments are publicly available on GitHub (http://github.com/erobl/csnn). …”
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  5. 2285
    “…TomoBEAR speeds up data processing, minimizes human interventions, and will help accelerate the adoption of in situ structural biology by cryo-ET. The source code and the documentation are freely available.…”
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  6. 2286
    “…AVAILABILITY AND IMPLEMENTATION: PanKmer is implemented as a Python package with components written in Rust, released under a BSD license. The source code is available from the Python Package Index (PyPI) at https://pypi.org/project/pankmer/ as well as Gitlab at https://gitlab.com/salk-tm/pankmer. …”
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  7. 2287
    “…Our tool represents a significant advancement in the analysis of spheroid images and will facilitate the widespread adoption of 3D spheroid models in scientific research. The source code and a detailed tutorial for SpheroScan are available at https://github.com/FunctionalUrology/SpheroScan.…”
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  8. 2288
    “…AVAILABILITY AND IMPLEMENTATION: Source code and datasets are respectively available at https://gitlab.inria.fr/nbuton/tfpc and https://doi.org/10.5281/zenodo.7253910…”
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  9. 2289
    “…AVAILABILITY AND IMPLEMENTATION: The source code and associated data can be accessed at https://github.com/yaozhong/bert_investigation.…”
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  10. 2290
    “…All documents for deCS, including source code, user manual, demo data, and tutorials, are freely available at https://github.com/bsml320/deCS.…”
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  11. 2291
  12. 2292
    “…AVAILABILITY AND IMPLEMENTATION: The source code and data can be downloaded from https://github.com/userd113/DNAS-main. …”
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  13. 2293
    “…AVAILABILITY AND IMPLEMENTATION: The used datasets along with the source code are made available through https://github.com/Z-Abbas/ORI-Explorer and https://zenodo.org/record/8358679.…”
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  14. 2294
  15. 2295
    “…Furthermore, we provide a source code for the construction of 2D plots and heatmaps which are easy to adapt to any T. cruzi strain.…”
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  16. 2296
    “…Providing AHHME open-source code and interactive online modelling tools allow for capacity building in AMR intervention modelling. …”
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  17. 2297
    “…To address this gap, we perform extensive tests in a real-world LoRaWAN environment, modifying the source code of both a LoRaWAN end device and open-source server stack to incorporate larger AES keys. …”
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  18. 2298
    “…MESIA is a shell-script-based open-source code that provides researchers involved in the epigenome with comprehensive insights.…”
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  19. 2299
  20. 2300
    “…The database includes Python source code for initial examination. The primary aim of the PHYAFB database is to provide a useful reference for other teams facing similar situations. …”
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