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  1. 721
    “…Availability and implementation: Source code, user guide and example data are available from https://github.com/richardmleggett/nextclip/. …”
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  2. 722
    “…We demonstrate the utility of the JEPETTO plugin on a set of misregulated genes associated with Alzheimer’s disease. Availability: Source code and binaries are freely available for download at http://apps.cytoscape.org/apps/jepetto, implemented in Java and multi-platform. …”
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  3. 723
    “…Availability and implementation: Source code and detailed documentation are available at http://montgomerylab.stanford.edu/spliceplot/index.html under Resources and at Github. …”
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  4. 724
    por Pohl, Andy, Beato, Miguel
    Publicado 2014
    “…Availability and implementation: The C source code is freely available under the GNU public license v3 at http://cromatina.crg.eu/bwtool. …”
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  5. 725
    “…FOCUS was implemented in Python. The source code and web-sever are freely available at http://edwards.sdsu.edu/FOCUS.…”
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  6. 726
    por Ghersi, Dario, Singh, Mona
    Publicado 2014
    “…Availability and implementation: molBLOCKS is available as GPL C++ source code at http://compbio.cs.princeton.edu/molblocks. …”
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  7. 727
    “…In this study, 800 source code files, collected and revised by the authors in classroom Computer Science lectures taught between 2013 and 2014, are analyzed with the proposed technique, and the most relevant metrics for the automatic grading task are discussed.…”
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  8. 728
  9. 729
    “…Availability and implementation: Source code is part of the C++ Energy Landscape Library available at http://www.bioinf.uni-freiburg.de/Software/. …”
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  10. 730
    “…Availability and implementation: The Ensembl REST API can be accessed at http://rest.ensembl.org and source code is freely available under an Apache 2.0 license from http://github.com/Ensembl/ensembl-rest. …”
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  11. 731
    “…cellPACK assembles computational models of the biological mesoscale, an intermediate scale (10(−7)–10(−8)m) between molecular and cellular biology. cellPACK’s modular architecture unites existing and novel packing algorithms to generate, visualize and analyze comprehensive 3D models of complex biological environments that integrate data from multiple experimental systems biology and structural biology sources. cellPACK is currently available as open source code, with tools for validation of models and with recipes and models for five biological systems: blood plasma, cytoplasm, synaptic vesicles, HIV and a mycoplasma cell. …”
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  12. 732
    “…Availability and implementation: The package is released under the Apache 2.0 open-source license. Source code, documentation and issue tracking are available at http://bitbucket.org/hgvs/hgvs/. …”
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  13. 733
    “…COMPASS is an open-source project licensed under GNU General Public License and is available for download from http://www.liu.se/forskning/foass/tidigare-foass/patrik-lundstrom/software?l=en. Source code and binaries for Linux, Mac OS X and Microsoft Windows are available.…”
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  14. 734
    “…Availability and implementation: QuasR is implemented in R and C/C++. Source code and binaries for major platforms (Linux, OS X and MS Windows) are available from Bioconductor (www.bioconductor.org/packages/release/bioc/html/QuasR.html). …”
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  15. 735
    por Newman, Scott
    Publicado 2015
    “…Availability and Implementation: Copy Number Explorer is available under the GNU public license (GPL-3). Source code is available at: https://sourceforge.net/projects/copynumberexplorer/ Contact: scott.newman@emory.edu…”
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  16. 736
    “…It is suitable as a straightforward standard solution for workflows dealing with mixed datasets. Binaries and source code (java and python) are available from http://sourceforge.net/projects/rambok/.…”
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  17. 737
    por Schmid, Benjamin, Huisken, Jan
    Publicado 2015
    “…Availability and implementation: Source code and binaries are available on github (https://github.com/bene51/), native code under the repository ‘gpu_deconvolution’, Java wrappers implementing Fiji plugins under ‘SPIM_Reconstruction_Cuda’. …”
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  18. 738
    “…In this paper we explore the accuracy of using self-reported estimates when compared with actual smartphone use. We also include source code to process and visualise these data. We compared 23 participants’ actual smartphone use over a two-week period with self-reported estimates and the Mobile Phone Problem Use Scale. …”
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  19. 739
  20. 740
    “…Availability and implementation: regioneR is an R package released under Artistic-2.0 License. The source code and documents are freely available through Bioconductor (http://www.bioconductor.org/packages/regioneR). …”
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