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21por Davis, Eric M., Sun, Yu, Liu, Yanling, Kolekar, Pandurang, Shao, Ying, Szlachta, Karol, Mulder, Heather L., Ren, Dongren, Rice, Stephen V., Wang, Zhaoming, Nakitandwe, Joy, Gout, Alexander M., Shaner, Bridget, Hall, Salina, Robison, Leslie L., Pounds, Stanley, Klco, Jeffery M., Easton, John, Ma, Xiaotu“…We demonstrate that SequencErr can reveal novel insights relative to the popular quality control method FastQC and achieve a 10-fold lower error rate than popular error correction methods including Lighter and Musket. CONCLUSIONS: Our study reveals novel insights into the nature of DNA sequencing errors incurred on DNA sequencers. …”
Publicado 2021
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24por Valliyodan, Babu, Dan Qiu, Patil, Gunvant, Zeng, Peng, Huang, Jiaying, Dai, Lu, Chen, Chengxuan, Li, Yanjun, Joshi, Trupti, Song, Li, Vuong, Tri D., Musket, Theresa A., Xu, Dong, Shannon, J. Grover, Shifeng, Cheng, Liu, Xin, Nguyen, Henry T.Enlace del recurso
Publicado 2016
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25por Manavalan, Lakshmi P., Prince, Silvas J., Musket, Theresa A., Chaky, Julian, Deshmukh, Rupesh, Vuong, Tri D., Song, Li, Cregan, Perry B., Nelson, James C., Shannon, J. Grover, Specht, James E., Nguyen, Henry T.Enlace del recurso
Publicado 2015
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26por Musket, Christie W., Hansen, Natasha S., Welker, Keith M., Gilbert, Kirsten E., Gruber, JuneEnlace del recurso
Publicado 2021
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27por Valliyodan, Babu, Brown, Anne V., Wang, Juexin, Patil, Gunvant, Liu, Yang, Otyama, Paul I., Nelson, Rex T., Vuong, Tri, Song, Qijian, Musket, Theresa A., Wagner, Ruth, Marri, Pradeep, Reddy, Sam, Sessions, Allen, Wu, Xiaolei, Grant, David, Bayer, Philipp E., Roorkiwal, Manish, Varshney, Rajeev K., Liu, Xin, Edwards, David, Xu, Dong, Joshi, Trupti, Cannon, Steven B., Nguyen, Henry T.Enlace del recurso
Publicado 2021
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28“…The precision of CARE 2.0 greatly reduces the number of those corrections compared to other state-of-the-art programs including BFC, Karect, Musket, Bcool, SGA, and Lighter. Thus, higher-quality datasets are produced which improve k-mer analysis and de-novo assembly in real-world datasets which demonstrates the applicability of machine learning techniques in the context of sequencing read error correction. …”
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29por Yim, Young-Sun, Moak, Patricia, Sanchez-Villeda, Hector, Musket, Theresa A, Close, Pamela, Klein, Patricia E, Mullet, John E, McMullen, Michael D, Fang, Zheiwei, Schaeffer, Mary L, Gardiner, Jack M, Coe, Edward H, Davis, Georgia LEnlace del recurso
Publicado 2007
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30por Qin, Yuan, Musket, Anna, Kou, Jianqun, Preiszner, Johanna, Tschida, Barbara R, Qin, Anna, Land, Craig A, Staal, Ben, Kang, Liang, Tanner, Kirk, Jiang, Yong, Schweitzer, John B, Largaespada, David A, Xie, QianEnlace del recurso
Publicado 2020
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31por Qin, Anna, Qin, Yuan, Lee, Joseph, Musket, Anna, Ying, Mingyao, Krenciute, Giedre, Marincola, Francesco M., Yao, Zhi Q., Musich, Phillip R., Xie, QianEnlace del recurso
Publicado 2023
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