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102por Serra, Angela, Fratello, Michele, Fortino, Vittorio, Raiconi, Giancarlo, Tagliaferri, Roberto, Greco, Dario“…The methodology is implemented in R and the source code is available online at http://neuronelab.unisa.it/a-multi-view-genomic-data-integration-methodology/. ELECTRONIC SUPPLEMENTARY MATERIAL: The online version of this article (doi:10.1186/s12859-015-0680-3) contains supplementary material, which is available to authorized users.…”
Publicado 2015
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103por Louhimo, Riku, Laakso, Marko, Belitskin, Denis, Klefström, Juha, Lehtonen, Rainer, Hautaniemi, Sampsa“…The selection of a precision therapy benefiting most patients is challenging but can be enhanced with integration of multiple types of molecular data. Data integration approaches for drug prioritization have successfully integrated diverse molecular data but do not take full advantage of existing data and literature. …”
Publicado 2016
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104por Wilkinson, Paul A., Winfield, Mark O., Barker, Gary L. A., Tyrrell, Simon, Bian, Xingdong, Allen, Alexandra M., Burridge, Amanda, Coghill, Jane A., Waterfall, Christy, Caccamo, Mario, Davey, Robert P., Edwards, Keith J.“…In addition, CerealsDB also contains new data on functional SNPs predicted to have a major effect on protein function and we have constructed a web service to encourage data integration and high-throughput programmatic access. …”
Publicado 2016
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106por Muto-Fujita, Ai, Takemoto, Kazuhiro, Kanaya, Shigehiko, Nakazato, Takeru, Tokimatsu, Toshiaki, Matsumoto, Natsushi, Kono, Mayo, Chubachi, Yuko, Ozaki, Katsuhisa, Kotera, Masaaki“…Our results demonstrate that data integration enables the computational detection of compounds putatively involved in particular interspecies interactions and that further data enrichment and integration of genomic and transcriptomic data facilitates the unveiling of the molecular mechanisms involved in host plant selection.…”
Publicado 2017
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107por Luo, Weijun, Pant, Gaurav, Bhavnasi, Yeshvant K., Blanchard, Steven G., Brouwer, Cory“…Pathway analysis is widely used in omics studies. Pathway-based data integration and visualization is a critical component of the analysis. …”
Publicado 2017
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108por Ukmar, G., Melloni, G. E. M., Raddrizzani, L., Rossi, P., Di Bella, S., Pirchio, M. R., Vescovi, M., Leone, A., Callari, M., Cesarini, M., Somaschini, A., Della Vedova, G., Daidone, M. G., Pettenella, M., Isacchi, A., Bosotti, R.Enlace del recurso
Publicado 2018
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109por Prasser, Fabian, Kohlbacher, Oliver, Mansmann, Ulrich, Bauer, Bernhard, Kuhn, Klaus A.“…For this purpose, the consortium Data Integration for Future Medicine (DIFUTURE) will establish Data Integration Centers (DICs) at university medical centers. …”
Publicado 2018
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113por Izumi, Yoshihiro, Matsuda, Fumio, Hirayama, Akiyoshi, Ikeda, Kazutaka, Kita, Yoshihiro, Horie, Kanta, Saigusa, Daisuke, Saito, Kosuke, Sawada, Yuji, Nakanishi, Hiroki, Okahashi, Nobuyuki, Takahashi, Masatomo, Nakao, Motonao, Hata, Kosuke, Hoshi, Yutaro, Morihara, Motohiko, Tanabe, Kazuhiro, Bamba, Takeshi, Oda, YoshiyaEnlace del recurso
Publicado 2019
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114“…Therefore, the study of the overall behavior of a metabolic network and the omics data integration and analysis must be approached from a holistic perspective. …”
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117por Lingjærde, Camilla, Lien, Tonje G., Borgan, Ørnulf, Bergholtz, Helga, Glad, Ingrid K.Enlace del recurso
Publicado 2021
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119por Luecken, Malte D., Büttner, M., Chaichoompu, K., Danese, A., Interlandi, M., Mueller, M. F., Strobl, D. C., Zappia, L., Dugas, M., Colomé-Tatché, M., Theis, Fabian J.“…Our freely available Python module and benchmarking pipeline can identify optimal data integration methods for new data, benchmark new methods and improve method development.…”
Publicado 2021
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