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4362por Louro, Bruno, De Moro, Gianluca, Garcia, Carlos, Cox, Cymon J, Veríssimo, Ana, Sabatino, Stephen J, Santos, António M, Canário, Adelino V M“…Variant calling on nearly half of the haplotype genome resulted in the identification of >2.3 million phased single-nucleotide polymorphisms with heterozygous loci. CONCLUSIONS: A draft genome was obtained, despite a high level of sequence repeats and heterozygosity, which are expected genome characteristics of a wild sardine. …”
Publicado 2019
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4363por Babalola, Olubukola Oluranti, Ayangbenro, Ayansina Segun, Olanrewaju, Oluwaseyi Samuel“…Here, we report the draft genome sequences of Bacillus subtilis A1, Sphingobacterium sp. strain A3, and Pseudomonas sp. strain A29; Sphingobacterium sp. …”
Publicado 2019
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4364“…Campylobacter bacteria are one of the leading causes of bacterial foodborne illnesses in the United States. Here, we report the draft genomic sequences of eight Campylobacter coli isolates from chicken carcasses, including virulence factors and antibiotic resistance.…”
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4365por Jiang, Xin, Zhang, Qian, Qin, Yaoguo, Yin, Hang, Zhang, Siyu, Li, Qian, Zhang, Yong, Fan, Jia, Chen, Julian“…CONCLUSIONS: We generated a high-quality draft of the S. miscanthi genome. This genome assembly should help promote research on the lifestyle and feeding specificity of aphids and their interactions with each other and species at other trophic levels. …”
Publicado 2019
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4366por Cheng, Peilin, Huang, Yu, Du, Hao, Li, Chuangju, Lv, Yunyun, Ruan, Rui, Ye, Huan, Bian, Chao, You, Xinxin, Xu, Junmin, Liang, Xufang, Shi, Qiong, Wei, Qiwei“…In this study, we performed whole genome sequencing, de novo assembly and gene annotation of the tarlet to construct its draft genome. Findings: We finally obtained a 1.83-Gb genome assembly (BUSCO completeness of 81.6%) from a total of 316.8-Gb raw reads generated by an Illumina Hiseq 2500 platform. …”
Publicado 2019
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4367por Zhou, Chuang, Tu, Hongmei, Yu, Haoran, Zheng, Shuai, Dai, Bo, Price, Megan, Wu, Yongjie, Yang, Nan, Yue, Bisong, Meng, Yang“…To examine the evolution and genomic features of Sichuan partridge, we de novo assembled the Sichuan partridge reference genome. The final draft assembly consisted of approximately 1.09 Gb, and had a scaffold N50 of 4.57 Mb. …”
Publicado 2019
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4368por Zhang, Yonghong, Zheng, Lanlan, Zheng, Yan, Zhou, Chao, Huang, Ping, Xiao, Xiao, Zhao, Yongheng, Hao, Xincai, Hu, Zhubing, Chen, Qinhua, Li, Hongliang, Wang, Xuanbin, Fukushima, Kenji, Wang, Guodong, Li, Chen“…The draft genome is ca. 2.56 Gb long, with 71.54% of the genome annotated as transposable elements. …”
Publicado 2019
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4369por Alonge, Michael, Soyk, Sebastian, Ramakrishnan, Srividya, Wang, Xingang, Goodwin, Sara, Sedlazeck, Fritz J., Lippman, Zachary B., Schatz, Michael C.Enlace del recurso
Publicado 2019
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4370por Liu, Yuan, Wu, Yuanyuan, Zhang, Yu, Yang, Xulei, Yang, En, Xu, Huini, Yang, Qiliang, Chagan, Irbis, Cui, Xiuming, Chen, Weimin, Yan, Jinping“…RESULTS: In the present study, Homokaryotic strains of T. trogii S0301 were screened and sequencing by PacBio Sequel II platform. The final draft genome is ~ 39.88 Mb, with a contig N50 size of 2.4 Mb, this was the first genome sequencing and assembly of T. trogii species. …”
Publicado 2019
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4371“…This work reports the draft genome sequence of Agrobacterium tumefaciens strain 1D1526. …”
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4372por Parales, Rebecca E., Sharma, Gaurav, Zhang, Xiangsheng, Subuyuj, Gabriel A., Langner, Jordan T., Wright, Matthew E., Ditty, Jayna L., Dawson, Scott C.“…We report here its high-quality draft genome sequence, assembled in 35 contigs totaling 5,630,907 bp. …”
Publicado 2019
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4373“…Pseudomonas aeruginosa is the major cause of bacterial keratitis, a sight-threatening ocular infection that can occur in contact lens wearers, as well as in others. Here, we report the draft genomes of 8 different P. aeruginosa corneal isolates, adding to the list of publicly available corneal infection-associated P. aeruginosa genomes.…”
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4374por da Fonseca, Rute R, Couto, Alvarina, Machado, Andre M, Brejova, Brona, Albertin, Carolin B, Silva, Filipe, Gardner, Paul, Baril, Tobias, Hayward, Alex, Campos, Alexandre, Ribeiro, Ângela M, Barrio-Hernandez, Inigo, Hoving, Henk-Jan, Tafur-Jimenez, Ricardo, Chu, Chong, Frazão, Barbara, Petersen, Bent, Peñaloza, Fernando, Musacchia, Francesco, Alexander, Graham C, Osório, Hugo, Winkelmann, Inger, Simakov, Oleg, Rasmussen, Simon, Rahman, M Ziaur, Pisani, Davide, Vinther, Jakob, Jarvis, Erich, Zhang, Guojie, Strugnell, Jan M, Castro, L Filipe C, Fedrigo, Olivier, Patricio, Mateus, Li, Qiye, Rocha, Sara, Antunes, Agostinho, Wu, Yufeng, Ma, Bin, Sanges, Remo, Vinar, Tomas, Blagoev, Blagoy, Sicheritz-Ponten, Thomas, Nielsen, Rasmus, Gilbert, M Thomas P“…CONCLUSIONS: This annotated draft genome of A. dux provides a critical resource to investigate the unique traits of this species, including its gigantism and key adaptations to deep-sea environments.…”
Publicado 2020
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4375“…Therefore, here we report a dataset of draft genome of G. boninense that was sequenced using Illumina Hiseq 2000. …”
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4376“…The genetic heterogeneity of L. reuteri is likely to contribute to differences in ecological performance within a host. Here, we report the draft genome sequences of 12 L. reuteri strains of rodent origin.…”
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4377por Wagle, Basanta R., Marasini, Daya, Upadhyaya, Indu, Shrestha, Sandip, Arsi, Komala, Donoghue, Annie M., Carbonero, Franck, Donoghue, Dan J., Maas, Kendra, Upadhyay, AbhinavEnlace del recurso
Publicado 2020
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4378por Gebru, Solomon T., Gangiredla, Jayanthi, Tournas, Vasiliki H., Tartera, Carmen, Mammel, Mark K.“…Here, we report the draft genome sequences of Alternaria alternata, isolated from seedless grapes, and Alternaria arborescens and Alternaria atra, isolated from Red Delicious apples, all from the Washington, DC, area.…”
Publicado 2020
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4379por Zhu, Chenglong, Xu, Wenjie, Li, Jianchuan, Liu, Chang, Hu, Mingliang, Yuan, Yuan, Yuan, Ke, Zhang, Yijiuling, Song, Xingzhi, Han, Jin, Cui, XinxinEnlace del recurso
Publicado 2020
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4380por Reghu, Rani Jalajakumari, Chellappan, Biju Vadakkemukadiyil, Beena, Shenu Hudson, Sasi, Anu, Vasudevan, Soniya Eppurathu, Nair, Achuthsankar Sukumaran“…Here, we present the first draft genome of P. splendens, which comprises 197 scaffolds with a total length of 53.3 Mb and 17,350 predicted protein-coding genes.…”
Publicado 2020
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