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4801“…BACKGROUND: Contiguous genome assemblies are a highly valued biological resource because of the higher number of completely annotated genes and genomic elements that are usable compared to fragmented draft genomes. Nonetheless, contiguity is difficult to obtain if only low coverage data and/or only distantly related reference genome assemblies are available. …”
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4802
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4803por Kumru, Salih, Tekedar, Hasan C., Griffin, Matt J., Waldbieser, Geoffrey C., Liles, Mark R., Sonstegard, Tad, Schroeder, Steven G., Lawrence, Mark L., Karsi, Attila“…Aeromonas bestiarum is a Gram-negative mesophilic motile bacterium causing acute hemorrhagic septicemia or chronic skin ulcers in fish. Here, we report the draft genome sequence of A. bestiarum strain GA97-22, which was isolated from rainbow trout in 1997. …”
Publicado 2018
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4804por Coombe, Lauren, Zhang, Jessica, Vandervalk, Benjamin P., Chu, Justin, Jackman, Shaun D., Birol, Inanc, Warren, René L.“…BACKGROUND: The long-range sequencing information captured by linked reads, such as those available from 10× Genomics (10xG), helps resolve genome sequence repeats, and yields accurate and contiguous draft genome assemblies. We introduce ARKS, an alignment-free linked read genome scaffolding methodology that uses linked reads to organize genome assemblies further into contiguous drafts. …”
Publicado 2018
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4805por Murat, Claude, Kuo, Alan, Barry, Kerrie W., Clum, Alicia, Dockter, Rhyan B., Fauchery, Laure, Iotti, Mirco, Kohler, Annegret, LaButti, Kurt, Lindquist, Erika A., Lipzen, Anna, Morin, Emmanuelle, Wang, Mei, Grigoriev, Igor V., Zambonelli, Alessandra, Martin, Francis M.“…This fungus is ubiquitous in Europe and is also cultivated outside Europe. Here, we present the draft genome sequence of T. borchii strain Tbo3840 (97.18 Mb in 969 scaffolds, with 12,346 predicted protein-coding genes).…”
Publicado 2018
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4806por Ortega, Daniel Barros, Costa, Rosiane Andrade, Pires, Allan Silva, Araújo, Thiago Fellipe, Araújo, Janaina Fernandez, Kurokawa, Adriane Silva, Magalhães, Beatriz Simas, Reis, Alessandra Maria Moreira, Franco, Octávio Luís, Kruger, Ricardo Henrique, Pappas, Georgios Joannis, Barreto, Cristine ChavesEnlace del recurso
Publicado 2018
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4807por Schuster, Heiko, Shao, Wenguang, Weiss, Tobias, Pedrioli, Patrick G.A., Roth, Patrick, Weller, Michael, Campbell, David S., Deutsch, Eric W., Moritz, Robert L., Planz, Oliver, Rammensee, Hans-Georg, Aebersold, Ruedi, Caron, Etienne“…We applied mass spectrometry (MS) technologies to draft the first tissue-based atlas of the murine MHC class I immunopeptidome in health. …”
Publicado 2018
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4808“…The “Pectobacterium peruviense” specie, recently proposed inside the Pectobacterium genus, gathers strains isolated from potato tubers cultivated in Peru at high altitude. Here we report the draft genome sequence of two strains belonging to “P. peruviense” isolated from river water in France indicating that the geographic distribution of this specie is likely to be larger than previously anticipated. …”
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4809por McDowell, Andrew, Hunyadkürti, Judit, Magyari, Márta, Vörös, Andrea, Horváth, Balázs, Patrick, Sheila, Nagy, István“…Propionibacterium acnes, a non-spore-forming anaerobic Gram-positive bacterium, has been linked to a wide range of opportunistic human infections and conditions, most notably acne vulgaris. Here, we present the draft genome sequence of P. acnes subsp. elongatum strain Asn12, isolated from spinal disc tissue (in the United Kingdom).…”
Publicado 2018
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4810
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4812“…Presented here is the draft genome sequence of Enterobacter cloacae 3F11. …”
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4813
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4815“…Here we report a draft genome sequence of Azoarcus communis SWub3, a nitrogen-fixing bacterium isolated from root tissues of Kallar grass in Pakistan.…”
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4816“…While the pathogenic species have been studied extensively, many commensals have limited genomic information available. Here, we present 24 draft genomes for a diverse set of 7 Haemophilus and Aggregatibacter species.…”
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4817“…Presented here is the draft genome sequence of Enterobacter cloacae 3D9. …”
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4818
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4819por Busch, Anne, Elschner, Mandy Carolina, Jacob, Daniela, Grunow, Roland, Tomaso, HerbertEnlace del recurso
Publicado 2018
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4820por Thibessard, Annabelle, Vicente, Cláudia M., Bertrand, Claire, Aigle, Bertrand, Leblond, Pierre“…The draft genome of Streptomyces sp. strain ETH9427 was sequenced and assembled into three large scaffolds, a 7.745-Mb linear chromosome with terminal inverted repeats of 201 kb and two probable extrachromosomal elements. …”
Publicado 2018
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