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10801por Ardley, Julie, Tian, Rui, Howieson, John, Yates, Ron, Bräu, Lambert, Han, James, Lobos, Elizabeth, Huntemann, Marcel, Chen, Amy, Mavromatis, Konstantinos, Markowitz, Victor, Ivanova, Natalia, Pati, Amrita, Goodwin, Lynne, Woyke, Tanja, Kyrpides, Nikos, Reeve, Wayne“…WSM2598, together with information and annotation of a high-quality draft genome sequence. The 7,669,765 bp draft genome is arranged in 5 scaffolds of 83 contigs, contains 7,236 protein-coding genes and 18 RNA-only encoding genes. …”
Publicado 2014
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10802por Shelton, Jennifer M., Coleman, Michelle C., Herndon, Nic, Lu, Nanyan, Lam, Ernest T., Anantharaman, Thomas, Sheth, Palak, Brown, Susan J.“…Thus a variety of tools and approaches are needed to improve draft genomes. RESULTS: We used a custom assembly workflow to optimize consensus genome map assembly, resulting in an assembly equal to the estimated length of the Tribolium castaneum genome and with an N50 of more than 1 Mb. …”
Publicado 2015
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10803por Mende, Daniel R., Aylward, Frank O., Eppley, John M., Nielsen, Torben N., DeLong, Edward F.“…Recent developments in single cell amplified genomes (SAGs) have enabled the sequencing of individual draft genomes representative of uncultivated microbial populations. …”
Publicado 2016
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10804por Schuelke, Taruna A., Westbrook, Anthony, Broders, Kirk, Woeste, Keith, MacManes, Matthew D.“…We present the first de novo draft genome of G. morbida. It is 26.5 Mbp in length and contains less than 1% repetitive elements. …”
Publicado 2016
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10805“…To test whether penguins have a reduced reliance on olfaction, we analyzed the draft genome sequences of the two penguins, which diverged at the origin of the order Sphenisciformes; we also examined six closely related species with available genomes, and identified 29 one-to-one orthologous olfactory receptor genes (i.e. …”
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10806“…This historical perspective highlights the challenges that future data sharing policies, including the recently disseminated NIH GDS Draft Policy, will encounter.…”
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10807por Guizelini, Dieval, Raittz, Roberto T., Cruz, Leonardo M., Souza, Emanuel M., Steffens, Maria B. R., Pedrosa, Fabio O.“…Only 13% of the prokaryotic genome sequencing projects have been completed. Draft genome sequences deposited in public databases are fragmented in contigs and may lack the full gene complement. …”
Publicado 2016
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10808por Du, Huihui, Fang, Rendong, Pan, Tingting, Li, Tian, Li, Nengzhang, He, Qiang, Wu, Rui, Peng, Yuanyi, Zhou, Zeyang“…The draft genome sequence of PmCQ6 is 2.29 Mbp and contains 1,970 protein-coding genes, 2 IS elements, and 3 prophage regions. …”
Publicado 2016
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10809“…Ninety percent of respondents agreed with both the evidence summary and the draft recommendations, while only 69% approved of the draft recommendations as a practice guideline. …”
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10810“…Concept elicitation interviews were conducted with patients to elicit their STS symptom experiences followed by a completion of the draft symptom list via web survey. A cognitive interview was conducted on the comprehension and importance of the symptom items. …”
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10811“…MATERIALS AND METHODS: A preliminary draft of protocol based on extensive review of the literature was developed. …”
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10812por Cai, Mingwei, Ng, Siu-Kin, Lim, Chee Kent, Lu, Hongyuan, Jia, Yangyang, Lee, Patrick K. H.“…Metagenomic and 16S rRNA gene sequencing revealed the presence and the draft genomes of Nitrosomonas-like AOB as well as Nitrobacter-like NOB in the cultures, including the first draft genome of Nitrobacter vulgaris. …”
Publicado 2018
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10813“…The main components of the diet were blue mussels Mytilus edulis (40%), draft whelk Nassarius reticulatus (27%), and periwinkle Littorina littorea (10%). …”
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10814“…The US Food and Drug Administration (FDA) developed a draft guidance for drug development in amyotrophic lateral sclerosis (ALS) that was issued in February 2018. …”
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10815por Axiak Flammer, Shannon, Eskes, Chantra, Kohler, Ingrid, Ochieng Pernet, Awilo, Jakob, Peter, Marahrens, Michael, Gent, Thomas C., Golledge, Huw, Weary, Dan“…The conclusion of this meeting was that a replacement is required, and the next step would be to draft a research strategy to find a suitable replacement. …”
Publicado 2019
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10816por Kammonen, Juhana I., Smolander, Olli-Pekka, Paulin, Lars, Pereira, Pedro A. B., Laine, Pia, Koskinen, Patrik, Jernvall, Jukka, Auvinen, Petri“…We conclude that gapFinisher can fill gaps in draft genomes quickly and reliably. In addition, the serial design of gapFinisher makes it scale well from prokaryote genomes to larger genomes with no increase in the computational footprint.…”
Publicado 2019
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10817por Tvedte, Eric S, Walden, Kimberly K O, McElroy, Kyle E, Werren, John H, Forbes, Andrew A, Hood, Glen R, Logsdon, John M, Feder, Jeffrey L, Robertson, Hugh M“…Identification of gene content confirmed the overall quality of the draft genome, and we manually annotated ∼400 genes as part of this study, including those involved in oxidative phosphorylation, chemosensation, and reproduction. …”
Publicado 2019
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10818“…The main premise of our methods centers around the idea that deep-drafted icebergs will become stranded in shallow water such that estimates of iceberg surface elevation can be used to infer draft, and thus water depth, under the assumption of hydrostatic equilibrium. …”
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10819por Turck, Dominique, Bresson, Jean‐Louis, Burlingame, Barbara, Dean, Tara, Fairweather‐Tait, Susan, Heinonen, Marina, Hirsch‐Ernst, Karen Ildico, Mangelsdorf, Inge, McArdle, Harry J, Naska, Androniki, Neuhäuser‐Berthold, Monika, Nowicka, Grażyna, Pentieva, Kristina, Sanz, Yolanda, Sjödin, Anders, Stern, Martin, Tomé, Daniel, Van Loveren, Henk, Vinceti, Marco, Willatts, Peter, Fewtrell, Mary, Przyrembel, Hildegard, Titz, Ariane, Valtueña Martínez, Silvia“…The NDA Panel endorsed a draft of this scientific opinion on 14 December 2016 for public consultation. …”
Publicado 2017
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10820por Verkley, Gerard, Perrone, Giancarlo, Piña, Mery, Scholz, Amber Hartman, Overmann, Jörg, Zuzuarregui, Aurora, Perugini, Iolanda, Turchetti, Benedetta, Hendrickx, Marijke, Stacey, Glyn, Law, Samantha, Russell, Julie, Smith, David, Lima, Nelson“…These tools provide guidance to collections seeking to draft an MDA and MTA, and are available in open access to be used, modified, and shared. …”
Publicado 2020
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