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1141“…Proteins with insignificant sequence and overall structure similarity may still share locally conserved contiguous structural segments; i.e. structural/3D motifs. …”
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1142RNAMotifScan: automatic identification of RNA structural motifs using secondary structural alignment“…Computational identification and analysis of RNA structural motifs remains a challenging task. Existing motif identification methods based on 3D structure may not properly compare motifs with high structural variations. …”
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1143“…BACKGROUND: When characterizing the structural topology of proteins, protein secondary structure (PSS) plays an important role in analyzing and modeling protein structures because it represents the local conformation of amino acids into regular structures. …”
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1144“…RESULTS: We propose a new method to predict protein structural classes on the basis of features extracted from the predicted secondary structures of proteins rather than directly from their amino acid sequences. …”
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1145por Leydesdorff, Loet“…These citation networks are intellectually organized by networks of expectations in the knowledge base at the specialty (that is, above-journal) level. The “structuration” of structural components (over time) can be measured as configurational information. …”
Publicado 2011
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1146por Córdoba, Rosa, Fernández-Pacheco, Rodrigo, Fernández-Pacheco, Amalio, Gloter, Alexandre, Magén, César, Stéphan, Odile, Ibarra, Manuel Ricardo, De Teresa, José María“…The obtained results allow us to correlate the chemical and structural properties with the functionality of these magnetic nanostructures.…”
Publicado 2011
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1147“…In comparison with the 3D structures of other prokaryotic ribosomes, the density map of the M. smegmatis 70S ribosome reveals unique structural features and their relative orientations in the ribosome. …”
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1148“…BACKGROUND: Work on protein structure prediction is very useful in biological research. …”
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1149“…Here, we introduce the protein structure idealization problem. We focus on the protein backbone structure idealization. …”
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1150por Elias, Mikael, Liebschner, Dorothee, Koepke, Jurgen, Lecomte, Claude, Guillot, Benoit, Jelsch, Christian, Chabriere, Eric“…This model was compared to the available neutron structure of DFPase, and differences in the protein and the active site solvation were noticed. …”
Publicado 2013
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1151“…In heterogeneous landscapes, physical barriers and loss of structural connectivity have been shown to reduce gene flow and therefore lead to population structuring. …”
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1152“…Thus, preference classification in combination with structural mere-exposure can be used to investigate structural sequence processing (syntax) in unsupervised AGL paradigms with proper learning designs.…”
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1153“…We have analyzed thousands of such structure pairs and found many of them share high structural similarity. …”
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1154por Nakabayashi, Makoto, Kataoka, Misumi, Mishima, Yumiko, Maeno, Yuka, Ishikawa, Kazuhiko“…In order to obtain more detailed structural data on BGLPf, the relationship between its tetrameric structure and the quality of the crystal was re-examined. …”
Publicado 2014
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1155“…Bioinformatic analysis highlighted the structural sarcomeric proteins as a candidate group for further analysis. …”
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1156“…Advances reported over the last few years and the increasing availability of protein crystal structure data have greatly improved structure-based druggability approaches. …”
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1157“…BACKGROUND: Protein structure data in Protein Data Bank (PDB) are widely used in studies of protein function and evolution and in protein structure prediction. …”
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1158“…In this paper we present an efficient cheminformatics tool, BioSMXpress that uses known endogenous mammalian biochemicals and graph matching methods to identify endogenous mammalian biochemical structures in chemical structure space. The results of a comprehensive set of empirical experiments suggest that BioSMXpress identifies endogenous mammalian biochemical structures with high accuracy. …”
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1159“…Consensus secondary structures were constructed for strongly correlated regions by taking into account both SHAPE probing structural data and nucleotide covariation information from structure-based alignments. …”
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1160por Böttcher, Bettina, Prazak, Vojtech, Rasmussen, Akiko, Black, Susan S., Rasmussen, Tim“…Here, we present the structure of YnaI by cryo-electron microscopy to a resolution of 13 Å. …”
Publicado 2015
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